More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1719 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 311 aa  598  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  69.75 
 
 		 337 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  71.52 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  69.48 
 
 		 309 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  70.39 
 
 		 309 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  68 
 
 		 307 aa  391  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  66.56 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  65.68 
 
 		 310 aa  368  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  65.25 
 
 		 311 aa  366  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  63.99 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  66.77 
 
 		 310 aa  360  2e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  60.13 
 
 		 315 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  59.16 
 
 		 308 aa  345  5e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  62.17 
 
 		 316 aa  345  7e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  58.99 
 
 		 324 aa  331  1e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  60.13 
 
 		 306 aa  330  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  59.74 
 
 		 310 aa  325  5e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11435  methionyl-tRNA formyltransferase  59.34 
 
 		 312 aa  319  3e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.406209 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  60.73 
 
 		 308 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  60.73 
 
 		 308 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0196795  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  60.73 
 
 		 308 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  60.33 
 
 		 315 aa  317  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  57.98 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  59.34 
 
 		 319 aa  316  3e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2350  methionyl-tRNA formyltransferase  58.5 
 
 		 313 aa  314  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3730  methionyl-tRNA formyltransferase  59.08 
 
 		 310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132882  normal  0.0191381 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  58.88 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2567  methionyl-tRNA formyltransferase  59.08 
 
 		 311 aa  305  7e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296174  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  57.05 
 
 		 311 aa  300  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1722  methionyl-tRNA formyltransferase  57.37 
 
 		 318 aa  297  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000240612  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  53.61 
 
 		 336 aa  296  3e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  52.41 
 
 		 317 aa  287  1e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  52.98 
 
 		 306 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  54.78 
 
 		 311 aa  272  5.000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  54.61 
 
 		 306 aa  268  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1966  methionyl-tRNA formyltransferase  43.3 
 
 		 328 aa  239  4e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  45.57 
 
 		 327 aa  219  6e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  36.33 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  40.58 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  41.58 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  37.9 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  39 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  40.66 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  34.52 
 
 		 309 aa  206  5e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10800  methionyl-tRNA formyltransferase  47.42 
 
 		 366 aa  205  8e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0126989  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0817  methionyl-tRNA formyltransferase  40.52 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  40.92 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  46.53 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  38.87 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  42.76 
 
 		 308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  36.24 
 
 		 312 aa  199  6e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  38.21 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  40.59 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  33.87 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  36.03 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  35.97 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  44.9 
 
 		 319 aa  196  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  37.89 
 
 		 320 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  37.13 
 
 		 318 aa  195  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  40.84 
 
 		 310 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  43.77 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  37.13 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  38.28 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  38.28 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  36.6 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  38.28 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  38.28 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  38.28 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2040  methionyl-tRNA formyltransferase  39.5 
 
 		 369 aa  193  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  41.18 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4814  methionyl-tRNA formyltransferase  37.46 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  37.29 
 
 		 315 aa  192  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  34.77 
 
 		 310 aa  192  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  37.99 
 
 		 317 aa  192  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  38.61 
 
 		 315 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  38.61 
 
 		 315 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  37.95 
 
 		 315 aa  192  8e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  38.61 
 
 		 315 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  38.61 
 
 		 315 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  38.61 
 
 		 315 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  37.95 
 
 		 315 aa  192  8e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  34.44 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1386  methionyl-tRNA formyltransferase  39.02 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.442669  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  36.63 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  37.95 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0040  methionyl-tRNA formyltransferase  35.48 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  37.62 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  40.92 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  41.61 
 
 		 320 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  39.48 
 
 		 311 aa  190  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  44.08 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  41.72 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  36.77 
 
 		 321 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3920  methionyl-tRNA formyltransferase  39.93 
 
 		 325 aa  189  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  39.23 
 
 		 314 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1642  methionyl-tRNA formyltransferase  38.76 
 
 		 312 aa  189  5e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  41.45 
 
 		 307 aa  189  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  36.88 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>