More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1642 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1642  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 312 aa  628  1e-179  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1524  methionyl-tRNA formyltransferase  97.12 
 
 		 320 aa  607  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1386  methionyl-tRNA formyltransferase  87.18 
 
 		 315 aa  567  1e-160  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.442669  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  46.2 
 
 		 311 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  44.26 
 
 		 315 aa  256  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  44.85 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  44.7 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  47.27 
 
 		 318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  45.07 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  42.95 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  43.23 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  46.03 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  44.7 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  43.38 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  43.04 
 
 		 312 aa  250  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  43.05 
 
 		 314 aa  249  4e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  43.89 
 
 		 310 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 314 aa  249  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  45.36 
 
 		 319 aa  248  9e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  42.77 
 
 		 315 aa  248  9e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  45.7 
 
 		 314 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  41.91 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  44.55 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  42.68 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  41.91 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  41.58 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  41.91 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  41.91 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  41.91 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  41.91 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  41.91 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  41.31 
 
 		 315 aa  245  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  41.31 
 
 		 315 aa  245  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  41.31 
 
 		 315 aa  245  8e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  42.24 
 
 		 313 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  41.91 
 
 		 315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  43.23 
 
 		 308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 315 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 315 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 315 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 315 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 315 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  41.61 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  47.02 
 
 		 314 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  42.77 
 
 		 315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2272  methionyl-tRNA formyltransferase  45.57 
 
 		 320 aa  239  5e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775496 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 332 aa  238  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  40.99 
 
 		 319 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0597  methionyl-tRNA formyltransferase  44.23 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.411489  normal  0.365023 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  41.99 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  45.18 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  41.99 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  42.44 
 
 		 323 aa  236  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  41.67 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  39.54 
 
 		 321 aa  236  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  38.41 
 
 		 312 aa  236  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 		 317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3920  methionyl-tRNA formyltransferase  44.55 
 
 		 325 aa  235  6e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  44.85 
 
 		 314 aa  235  9e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  40.32 
 
 		 317 aa  235  9e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  44.7 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  40.33 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4832  methionyl-tRNA formyltransferase  42.3 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000322713  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  41.47 
 
 		 307 aa  232  5e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  44.12 
 
 		 307 aa  232  6e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  43.09 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  43.46 
 
 		 307 aa  229  3e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  38.61 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  41.08 
 
 		 324 aa  230  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  39.16 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  39.22 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  43.09 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  43.51 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  40.73 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  44.3 
 
 		 299 aa  225  7e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  42.9 
 
 		 320 aa  225  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  38.56 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  38.56 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  38.56 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  38.56 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0014  methionyl-tRNA formyltransferase  43.75 
 
 		 329 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  41.21 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  38.28 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  38.44 
 
 		 329 aa  223  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  43.09 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  38.24 
 
 		 318 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  35.94 
 
 		 320 aa  222  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  37.58 
 
 		 311 aa  222  7e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 348 aa  222  7e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.596014  normal  0.0248257 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  38.08 
 
 		 310 aa  222  8e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  38.28 
 
 		 318 aa  221  8e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  37.95 
 
 		 318 aa  222  8e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  38.28 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0021  methionyl-tRNA formyltransferase  42.53 
 
 		 313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.223082 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  42.53 
 
 		 313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  40.89 
 
 		 313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>