More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0568 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 311 aa  642    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  64.1 
 
 		 312 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  53.55 
 
 		 310 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  52.9 
 
 		 317 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  54.52 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  54.19 
 
 		 309 aa  338  5.9999999999999996e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  49.68 
 
 		 315 aa  330  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  50.48 
 
 		 317 aa  325  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  50.48 
 
 		 311 aa  325  6e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  49.2 
 
 		 313 aa  325  9e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  49.52 
 
 		 318 aa  316  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  49.52 
 
 		 318 aa  316  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  47.91 
 
 		 312 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  46.69 
 
 		 319 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  49.03 
 
 		 316 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  48.7 
 
 		 319 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  47.59 
 
 		 311 aa  301  7.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  47.74 
 
 		 359 aa  297  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1005  methionyl-tRNA formyltransferase  44.65 
 
 		 317 aa  295  5e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00554605  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  44.62 
 
 		 316 aa  292  6e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  43.61 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  46.08 
 
 		 313 aa  289  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  44.84 
 
 		 311 aa  288  9e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  44.44 
 
 		 315 aa  286  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  45.14 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  44.22 
 
 		 318 aa  272  6e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  44.52 
 
 		 312 aa  271  7e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  44.23 
 
 		 312 aa  271  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  45.13 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  44.01 
 
 		 311 aa  268  8.999999999999999e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  43.46 
 
 		 315 aa  267  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  41.61 
 
 		 312 aa  267  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  44.19 
 
 		 318 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  42.48 
 
 		 304 aa  265  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  43.05 
 
 		 311 aa  263  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  45.24 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  40.51 
 
 		 314 aa  263  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  44.84 
 
 		 308 aa  261  8e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  41.53 
 
 		 314 aa  260  3e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  41.53 
 
 		 314 aa  260  3e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  42.95 
 
 		 319 aa  258  6e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  42.63 
 
 		 314 aa  258  8e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  43.67 
 
 		 310 aa  257  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  44.23 
 
 		 319 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  41.48 
 
 		 309 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 		 310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  42.63 
 
 		 314 aa  253  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  42.49 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  42.57 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  42.38 
 
 		 311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  42.38 
 
 		 311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  41.04 
 
 		 307 aa  252  7e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  44.19 
 
 		 320 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09618  methionyl-tRNA formyltransferase  41.1 
 
 		 315 aa  251  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315311  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  41.85 
 
 		 310 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 		 314 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 		 314 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2139  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 361 aa  249  4e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931795 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 		 314 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 		 314 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  41.21 
 
 		 314 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0972  methionyl-tRNA formyltransferase  42.02 
 
 		 314 aa  249  5e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.319816  normal  0.276171 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  42.62 
 
 		 318 aa  249  5e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  40.66 
 
 		 314 aa  249  6e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  42.63 
 
 		 314 aa  248  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  41.99 
 
 		 314 aa  248  7e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  42.63 
 
 		 314 aa  248  7e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  41.91 
 
 		 302 aa  248  8e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.117163  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  41.85 
 
 		 310 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  40.33 
 
 		 314 aa  248  9e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  40.89 
 
 		 310 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  44.09 
 
 		 323 aa  248  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  43.42 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  42.38 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  41.74 
 
 		 333 aa  246  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0393  methionyl-tRNA formyltransferase  44.55 
 
 		 312 aa  246  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.894516  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  41.95 
 
 		 318 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  41.95 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  42.62 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  41.95 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0817  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 316 aa  243  3e-63  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  41.69 
 
 		 319 aa  243  3e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0373  methionyl-tRNA formyltransferase  38.83 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  41.28 
 
 		 318 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  42.95 
 
 		 325 aa  242  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  41.61 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2040  methionyl-tRNA formyltransferase  41.56 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  42.59 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  41.61 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  40.89 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  42.05 
 
 		 315 aa  240  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  42.05 
 
 		 315 aa  240  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  40.58 
 
 		 314 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  42.05 
 
 		 315 aa  240  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  42.05 
 
 		 315 aa  240  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  42.05 
 
 		 315 aa  240  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  41.61 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>