More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2139 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_2139  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 361 aa  743    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931795 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2467  methionyl-tRNA formyltransferase  87.6 
 
 		 363 aa  656    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0926432 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  68.1 
 
 		 348 aa  480  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.596014  normal  0.0248257 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  52.31 
 
 		 311 aa  318  1e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  49.54 
 
 		 318 aa  309  4e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  46.46 
 
 		 315 aa  296  3e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  45.19 
 
 		 329 aa  291  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  45.85 
 
 		 315 aa  290  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  46.36 
 
 		 315 aa  288  7e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  46.41 
 
 		 332 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  46.97 
 
 		 312 aa  286  4e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  46.39 
 
 		 310 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  46.39 
 
 		 310 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  44.21 
 
 		 318 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  44.51 
 
 		 318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  43.92 
 
 		 318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  47.4 
 
 		 310 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  46.39 
 
 		 310 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  44.65 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  46.86 
 
 		 314 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  43.92 
 
 		 318 aa  280  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  44.94 
 
 		 310 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  43.62 
 
 		 318 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  45.34 
 
 		 321 aa  278  9e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  43.62 
 
 		 318 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  43.62 
 
 		 318 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  45.12 
 
 		 314 aa  276  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  43.62 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  43.32 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  45.81 
 
 		 319 aa  275  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  44.64 
 
 		 320 aa  276  6e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  45.32 
 
 		 314 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  45.43 
 
 		 314 aa  272  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  43.9 
 
 		 315 aa  272  7e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  43.6 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  45.54 
 
 		 313 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  43.9 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  44.21 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  43.6 
 
 		 315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  43.6 
 
 		 315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  45.6 
 
 		 314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  43.6 
 
 		 315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  46.63 
 
 		 311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  43.6 
 
 		 315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  43.6 
 
 		 315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  45.12 
 
 		 316 aa  269  5.9999999999999995e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  44.51 
 
 		 315 aa  268  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  44.51 
 
 		 315 aa  268  8.999999999999999e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  44.51 
 
 		 315 aa  268  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  43.6 
 
 		 315 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  42.86 
 
 		 320 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  43.69 
 
 		 312 aa  268  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  44.44 
 
 		 331 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0831  methionyl-tRNA formyltransferase  47.89 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  45.05 
 
 		 315 aa  267  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  46.3 
 
 		 322 aa  266  4e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  45.99 
 
 		 320 aa  265  7e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3877  methionyl-tRNA formyltransferase  45.97 
 
 		 323 aa  265  8e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  43.67 
 
 		 307 aa  265  8.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0040  methionyl-tRNA formyltransferase  44.27 
 
 		 317 aa  264  1e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  44.95 
 
 		 319 aa  264  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3564  methionyl-tRNA formyltransferase  43.55 
 
 		 344 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  46.89 
 
 		 314 aa  263  4.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  46.56 
 
 		 314 aa  263  4.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  44.61 
 
 		 325 aa  262  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  43.77 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  43.77 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  43.77 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  42.94 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  43.77 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  43.77 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  46.08 
 
 		 323 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  42.99 
 
 		 324 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  43.44 
 
 		 327 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0129  methionyl-tRNA formyltransferase  45.29 
 
 		 328 aa  260  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  45.78 
 
 		 323 aa  260  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  44.08 
 
 		 315 aa  260  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  43.38 
 
 		 313 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  43.9 
 
 		 315 aa  259  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  47.9 
 
 		 308 aa  259  7e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  45.57 
 
 		 327 aa  258  8e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0072  methionyl-tRNA formyltransferase  43.77 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  40.54 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4638  methionyl-tRNA formyltransferase  44.21 
 
 		 357 aa  258  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.857325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3859  methionyl-tRNA formyltransferase  44.54 
 
 		 323 aa  256  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0015  methionyl-tRNA formyltransferase  48.19 
 
 		 309 aa  255  8e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.229268 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  43.15 
 
 		 327 aa  255  9e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  47.06 
 
 		 307 aa  255  9e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0160  methionyl-tRNA formyltransferase  43.24 
 
 		 327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0284  methionyl-tRNA formyltransferase  48.26 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0176978 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  42.09 
 
 		 323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  41.67 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  43.24 
 
 		 327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3064  methionyl-tRNA formyltransferase  43.82 
 
 		 327 aa  252  7e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0143  methionyl-tRNA formyltransferase  43.24 
 
 		 327 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2805  methionyl-tRNA formyltransferase  43.24 
 
 		 337 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2353  methionyl-tRNA formyltransferase  43.24 
 
 		 337 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2275  methionyl-tRNA formyltransferase  43.24 
 
 		 337 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  41.32 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3181  methionyl-tRNA formyltransferase  43.53 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>