More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1176 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
309 aa  619  1e-176  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0373  methionyl-tRNA formyltransferase  54.3 
 
 
308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  47.57 
 
 
309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  47.74 
 
 
311 aa  271  7e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  41.58 
 
 
359 aa  271  8.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  41.67 
 
 
311 aa  267  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  45.24 
 
 
311 aa  263  3e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  41.25 
 
 
312 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  39.81 
 
 
315 aa  262  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  42.12 
 
 
312 aa  261  8e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  42.02 
 
 
311 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  41.37 
 
 
317 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  44.19 
 
 
310 aa  258  9e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  41.18 
 
 
318 aa  258  9e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  40.52 
 
 
318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  42.22 
 
 
319 aa  253  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  41.28 
 
 
311 aa  251  9.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  41.28 
 
 
311 aa  251  9.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  40.32 
 
 
316 aa  251  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  41.88 
 
 
309 aa  250  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  38.83 
 
 
311 aa  248  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  43.55 
 
 
309 aa  248  7e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  42.49 
 
 
314 aa  248  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  41.67 
 
 
318 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  38.69 
 
 
316 aa  246  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  38.38 
 
 
319 aa  245  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  38.94 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  41.27 
 
 
315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  40.78 
 
 
314 aa  242  5e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  39.33 
 
 
313 aa  242  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 
317 aa  241  9e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  38.94 
 
 
320 aa  241  9e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  40.78 
 
 
314 aa  239  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  40.78 
 
 
314 aa  239  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  38.39 
 
 
333 aa  239  5.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  39.68 
 
 
314 aa  238  8e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  39.68 
 
 
314 aa  238  8e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  40.94 
 
 
310 aa  238  1e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 
314 aa  237  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  40.45 
 
 
314 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 
314 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 
314 aa  237  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 
314 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 
314 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 
314 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  41.75 
 
 
309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  38.39 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 
329 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  38.71 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  39.03 
 
 
308 aa  233  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  36 
 
 
311 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  37.21 
 
 
314 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3481  methionyl-tRNA formyltransferase  38.18 
 
 
334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.902308 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  34.55 
 
 
312 aa  231  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  37.86 
 
 
312 aa  230  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  37.46 
 
 
314 aa  229  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  38.21 
 
 
310 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  36.89 
 
 
318 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  34.95 
 
 
324 aa  229  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  37.46 
 
 
314 aa  229  4e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2110  methionyl-tRNA formyltransferase  33.95 
 
 
327 aa  229  4e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.6282 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  37.22 
 
 
314 aa  229  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  37.99 
 
 
310 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  37.21 
 
 
313 aa  229  6e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1572  methionyl-tRNA formyltransferase  36.06 
 
 
332 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  36.54 
 
 
320 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  39.73 
 
 
319 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  36.88 
 
 
314 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 
307 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0883  methionyl-tRNA formyltransferase  37.13 
 
 
334 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  37.34 
 
 
319 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  39.27 
 
 
304 aa  226  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09618  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 
315 aa  226  4e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315311  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  36.57 
 
 
318 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 
310 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  38.24 
 
 
326 aa  225  6e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  35.28 
 
 
318 aa  225  6e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 
310 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  36.25 
 
 
318 aa  225  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  35.92 
 
 
332 aa  225  7e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  36.6 
 
 
310 aa  225  8e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  34.44 
 
 
319 aa  225  8e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1769  methionyl-tRNA formyltransferase  39.39 
 
 
336 aa  225  8e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.161248  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  35.55 
 
 
318 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 
314 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1548  methionyl-tRNA formyltransferase  35.45 
 
 
332 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  35.69 
 
 
314 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0148  methionyl-tRNA formyltransferase  35.53 
 
 
305 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.576123 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  35.88 
 
 
318 aa  223  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  35.55 
 
 
310 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0449  methionyl-tRNA formyltransferase  36.22 
 
 
342 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353128  normal  0.364478 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  36.54 
 
 
315 aa  223  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  35.69 
 
 
320 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  35.88 
 
 
307 aa  222  7e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  36.25 
 
 
313 aa  222  7e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 
302 aa  222  7e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.117163  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  36.91 
 
 
311 aa  221  9e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  35.55 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  36.88 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1005  methionyl-tRNA formyltransferase  38.54 
 
 
317 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00554605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>