More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09618 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09618  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 315 aa  651    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315311  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0138  methionyl-tRNA formyltransferase  57.01 
 
 		 315 aa  372  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.483644  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  52.13 
 
 		 316 aa  323  3e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  47.87 
 
 		 304 aa  285  5e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4814  methionyl-tRNA formyltransferase  45.82 
 
 		 297 aa  279  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  43.97 
 
 		 315 aa  279  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  45.78 
 
 		 320 aa  275  7e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  44.87 
 
 		 312 aa  270  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  46.38 
 
 		 302 aa  268  5.9999999999999995e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.117163  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_002950  PG2023  methionyl-tRNA formyltransferase  42.77 
 
 		 323 aa  267  1e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.030686 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  40.58 
 
 		 312 aa  252  5.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  41.1 
 
 		 311 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  43.61 
 
 		 317 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1921  hypothetical protein  44.97 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  39.09 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 		 309 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  43 
 
 		 309 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  39.94 
 
 		 317 aa  238  8e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  39.12 
 
 		 319 aa  238  9e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  40.33 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  39.47 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  40.19 
 
 		 311 aa  235  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  38.92 
 
 		 313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  40.5 
 
 		 317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793908 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  39.62 
 
 		 318 aa  231  9e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  39.3 
 
 		 318 aa  230  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  38.11 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  39.1 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  36.81 
 
 		 314 aa  225  9e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 		 315 aa  225  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  36.81 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  38.06 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  38.59 
 
 		 319 aa  223  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  36.42 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1678  methionyl-tRNA formyltransferase  41.72 
 
 		 318 aa  223  3e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  38.66 
 
 		 310 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  40.76 
 
 		 325 aa  222  7e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  37.9 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  38.44 
 
 		 315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  37.9 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  37.86 
 
 		 312 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  37.58 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  36.27 
 
 		 321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 		 315 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 		 315 aa  219  6e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 		 315 aa  219  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 		 315 aa  219  6e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  39.8 
 
 		 315 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  39.47 
 
 		 315 aa  218  7.999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  35.71 
 
 		 324 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  39.47 
 
 		 313 aa  218  8.999999999999998e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  39.47 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  39.47 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  39.14 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  38.36 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  38.61 
 
 		 313 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1472  methionyl-tRNA formyltransferase  39.54 
 
 		 314 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  36.51 
 
 		 310 aa  215  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  38.61 
 
 		 314 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  37.83 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  39.14 
 
 		 315 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  39.14 
 
 		 315 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  39.14 
 
 		 315 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  39.14 
 
 		 315 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1787  methionyl-tRNA formyltransferase  38.36 
 
 		 319 aa  212  5.999999999999999e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  38.03 
 
 		 310 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  38.02 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  36.16 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  38.36 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  38.82 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  38.8 
 
 		 316 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0487  methionyl-tRNA formyltransferase  36.83 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  37.46 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1860  methionyl-tRNA formyltransferase  39.16 
 
 		 315 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.346485  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  40.06 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  35.92 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2040  methionyl-tRNA formyltransferase  36.45 
 
 		 369 aa  209  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  36.84 
 
 		 312 aa  209  5e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  36.22 
 
 		 314 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  37.7 
 
 		 307 aa  209  6e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  38.16 
 
 		 315 aa  209  6e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  36.72 
 
 		 320 aa  209  7e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  37.29 
 
 		 301 aa  208  8e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  37.17 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  35.9 
 
 		 314 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  35.9 
 
 		 314 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  37.17 
 
 		 306 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  35.9 
 
 		 314 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  35.5 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  36.69 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  35.9 
 
 		 314 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  36.63 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3065  methionyl-tRNA formyltransferase  37.25 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  37.17 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  36.84 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  37.7 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>