More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0019 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 327 aa  676    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  58.51 
 
 		 324 aa  388  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  58.26 
 
 		 321 aa  385  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  58.95 
 
 		 315 aa  385  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  58.51 
 
 		 320 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  57.89 
 
 		 315 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  59.81 
 
 		 318 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  59.06 
 
 		 321 aa  381  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  60.12 
 
 		 318 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  58.54 
 
 		 319 aa  378  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  59.81 
 
 		 318 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  58.33 
 
 		 318 aa  378  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  58.88 
 
 		 318 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  58.2 
 
 		 329 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  59.18 
 
 		 318 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  59.49 
 
 		 318 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  57.28 
 
 		 315 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  59.24 
 
 		 318 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  59.18 
 
 		 318 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  56.11 
 
 		 313 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  59.74 
 
 		 318 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  56.17 
 
 		 315 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0040  methionyl-tRNA formyltransferase  54.04 
 
 		 317 aa  358  8e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  55.45 
 
 		 316 aa  355  5e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  53.87 
 
 		 315 aa  355  6.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  54.83 
 
 		 312 aa  354  1e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  55.9 
 
 		 320 aa  353  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  54.18 
 
 		 314 aa  352  5e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  55.11 
 
 		 315 aa  349  4e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  55.11 
 
 		 315 aa  349  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  55.11 
 
 		 315 aa  349  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  54.86 
 
 		 313 aa  348  6e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  53.4 
 
 		 315 aa  348  7e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  53.56 
 
 		 315 aa  347  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  53.56 
 
 		 315 aa  347  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  53.56 
 
 		 315 aa  347  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  53.56 
 
 		 315 aa  347  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  53.56 
 
 		 315 aa  347  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  53.56 
 
 		 315 aa  347  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  53.56 
 
 		 315 aa  347  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  55.45 
 
 		 322 aa  346  3e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  52.94 
 
 		 315 aa  345  6e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  53.09 
 
 		 315 aa  342  5e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  53.56 
 
 		 315 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  52.63 
 
 		 315 aa  339  4e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  53.25 
 
 		 315 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  53.25 
 
 		 315 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  53.25 
 
 		 315 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  53.25 
 
 		 315 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  49.54 
 
 		 314 aa  325  9e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  49.54 
 
 		 314 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  48.93 
 
 		 314 aa  316  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 312 aa  316  4e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  47.66 
 
 		 310 aa  315  5e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  49.22 
 
 		 310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  48.31 
 
 		 314 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  48.29 
 
 		 310 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  47.98 
 
 		 310 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  48.44 
 
 		 319 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  47.98 
 
 		 310 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  47.53 
 
 		 325 aa  303  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  45.45 
 
 		 314 aa  303  4.0000000000000003e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  45.45 
 
 		 314 aa  303  4.0000000000000003e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  50.8 
 
 		 318 aa  301  9e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  45.94 
 
 		 311 aa  301  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  49.84 
 
 		 332 aa  296  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  48.86 
 
 		 314 aa  295  6e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  48.86 
 
 		 314 aa  295  8e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0415  methionyl-tRNA formyltransferase  44.83 
 
 		 311 aa  289  5.0000000000000004e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.467918  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  46.91 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  46.65 
 
 		 325 aa  281  9e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  47.45 
 
 		 323 aa  277  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  46.79 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  45.89 
 
 		 307 aa  273  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  45.98 
 
 		 307 aa  268  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  44.48 
 
 		 307 aa  264  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  43.45 
 
 		 348 aa  263  4e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.596014  normal  0.0248257 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2467  methionyl-tRNA formyltransferase  44.18 
 
 		 363 aa  262  6e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0926432 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  46.1 
 
 		 308 aa  260  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2139  methionyl-tRNA formyltransferase  45.57 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931795 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  43.18 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  42.59 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0129  methionyl-tRNA formyltransferase  43.75 
 
 		 328 aa  248  7e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  42.09 
 
 		 307 aa  248  1e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0393  methionyl-tRNA formyltransferase  43.55 
 
 		 312 aa  246  4e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.894516  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3064  methionyl-tRNA formyltransferase  44.06 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3181  methionyl-tRNA formyltransferase  43.75 
 
 		 327 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3123  methionyl-tRNA formyltransferase  43.44 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.760657  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  42.32 
 
 		 323 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0036  methionyl-tRNA formyltransferase  43.48 
 
 		 327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  40.99 
 
 		 327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  41.61 
 
 		 301 aa  242  6e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  42.32 
 
 		 323 aa  242  7e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  42.53 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0072  methionyl-tRNA formyltransferase  42.24 
 
 		 327 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6477  methionyl-tRNA formyltransferase  43.12 
 
 		 327 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.79537 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3142  methionyl-tRNA formyltransferase  43.03 
 
 		 330 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4638  methionyl-tRNA formyltransferase  42.63 
 
 		 357 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.857325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2272  methionyl-tRNA formyltransferase  44.01 
 
 		 320 aa  239  4e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775496 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  40.68 
 
 		 327 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>