More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_09900 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
316 aa  640    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  52.22 
 
 
312 aa  323  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  48.88 
 
 
310 aa  306  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  46.52 
 
 
315 aa  295  6e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  47.13 
 
 
359 aa  295  8e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  44.62 
 
 
311 aa  292  6e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  46.84 
 
 
311 aa  289  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  46.37 
 
 
319 aa  286  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  44.51 
 
 
320 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  46.69 
 
 
317 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  45.57 
 
 
311 aa  279  4e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  47.96 
 
 
318 aa  278  7e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  43.71 
 
 
312 aa  278  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  45.25 
 
 
318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  46.37 
 
 
311 aa  273  3e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  45.43 
 
 
314 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  45.43 
 
 
314 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  45.43 
 
 
314 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  47.15 
 
 
309 aa  272  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  45.43 
 
 
314 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  45.74 
 
 
314 aa  272  6e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  44.79 
 
 
314 aa  272  6e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  45.25 
 
 
318 aa  272  7e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  47.15 
 
 
309 aa  271  8.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  44.62 
 
 
313 aa  271  9e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  43.99 
 
 
317 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  45.74 
 
 
314 aa  270  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  45.11 
 
 
314 aa  270  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  45.11 
 
 
314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  45.43 
 
 
314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  46.79 
 
 
309 aa  268  8e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  43.35 
 
 
312 aa  265  8.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  43.17 
 
 
319 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  44.12 
 
 
311 aa  254  9e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  42.09 
 
 
318 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  41.46 
 
 
313 aa  252  5.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  40.32 
 
 
309 aa  251  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 
320 aa  250  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  44.97 
 
 
319 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  40.51 
 
 
313 aa  249  4e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  43.04 
 
 
315 aa  247  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  41.53 
 
 
316 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  40.82 
 
 
311 aa  244  9e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  42.43 
 
 
315 aa  242  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  41.19 
 
 
312 aa  241  7.999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  41.78 
 
 
315 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  41.1 
 
 
311 aa  241  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  39.25 
 
 
314 aa  241  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  41.45 
 
 
315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  41.45 
 
 
315 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  41.45 
 
 
315 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  41.45 
 
 
315 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  41.4 
 
 
311 aa  239  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  41.45 
 
 
315 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  41.45 
 
 
315 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  41.4 
 
 
311 aa  239  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  43.09 
 
 
315 aa  238  6.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2467  methionyl-tRNA formyltransferase  38.05 
 
 
363 aa  237  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0926432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  41.78 
 
 
319 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  40.63 
 
 
314 aa  236  4e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  40.63 
 
 
314 aa  236  4e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  42.04 
 
 
310 aa  236  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  40.51 
 
 
312 aa  235  6e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  41.12 
 
 
315 aa  235  7e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0072  methionyl-tRNA formyltransferase  40.18 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2139  methionyl-tRNA formyltransferase  38.1 
 
 
361 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00931795 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  39.12 
 
 
308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 
348 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.596014  normal  0.0248257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  42.14 
 
 
318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  41.81 
 
 
318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  38.92 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  39.24 
 
 
308 aa  233  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  41.35 
 
 
304 aa  232  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 
315 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  41.47 
 
 
318 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  36.83 
 
 
307 aa  232  7.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 
315 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 
315 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  39.75 
 
 
328 aa  232  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 
315 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 
315 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  39.39 
 
 
333 aa  232  8.000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  38.65 
 
 
327 aa  231  9e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  39.88 
 
 
332 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  40.27 
 
 
314 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  40.79 
 
 
314 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  41.81 
 
 
318 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  40.63 
 
 
301 aa  228  8e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  39.94 
 
 
305 aa  228  9e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  40.79 
 
 
310 aa  228  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  40.47 
 
 
310 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  40.8 
 
 
310 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  38.04 
 
 
327 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1548  methionyl-tRNA formyltransferase  37.27 
 
 
332 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  38.68 
 
 
310 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  40.94 
 
 
318 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  40.94 
 
 
318 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  41.33 
 
 
315 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  41.33 
 
 
315 aa  226  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0148  methionyl-tRNA formyltransferase  38.59 
 
 
305 aa  226  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.576123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>