More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0148 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0148  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 305 aa  600  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.576123 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  49.51 
 
 		 317 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  50.33 
 
 		 311 aa  288  9e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  47.54 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  47.54 
 
 		 318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  47.87 
 
 		 318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  45.57 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  47.04 
 
 		 316 aa  266  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  47.54 
 
 		 319 aa  266  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  42.35 
 
 		 312 aa  261  8e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  45.28 
 
 		 313 aa  259  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  46.73 
 
 		 359 aa  256  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  42.48 
 
 		 317 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  45.57 
 
 		 311 aa  255  7e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  45.71 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  42.95 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  41.25 
 
 		 310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  42.02 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  43.46 
 
 		 311 aa  243  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  41.36 
 
 		 318 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  40.32 
 
 		 314 aa  239  5.999999999999999e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  41.72 
 
 		 314 aa  238  5.999999999999999e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  41.72 
 
 		 314 aa  238  5.999999999999999e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  43.39 
 
 		 319 aa  238  9e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  45.07 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3564  methionyl-tRNA formyltransferase  42.99 
 
 		 344 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  43.04 
 
 		 320 aa  235  8e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  39.02 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  39.02 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  39.02 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  39.02 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0036  methionyl-tRNA formyltransferase  43.27 
 
 		 327 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  44.74 
 
 		 308 aa  233  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  38.69 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  45.93 
 
 		 320 aa  232  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  45.61 
 
 		 307 aa  232  6e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  46.86 
 
 		 302 aa  232  6e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  39.34 
 
 		 314 aa  232  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  40.06 
 
 		 316 aa  232  6e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  38.69 
 
 		 314 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  45.33 
 
 		 310 aa  232  7.000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  39.23 
 
 		 319 aa  231  8.000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  38.69 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  41.83 
 
 		 324 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  38.06 
 
 		 315 aa  229  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  47.04 
 
 		 302 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  39.54 
 
 		 318 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  38.36 
 
 		 314 aa  229  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  38.36 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  44.08 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  35.93 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  39.54 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  35.93 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  41.9 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  39.73 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 313 aa  226  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  42.9 
 
 		 307 aa  226  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 318 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  36.72 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  39.54 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  39.22 
 
 		 318 aa  226  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  39.54 
 
 		 318 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  45.57 
 
 		 302 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  43.1 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  38.64 
 
 		 312 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  40.52 
 
 		 320 aa  221  9e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  37.63 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  43.92 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  39.22 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  42.76 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  39.22 
 
 		 329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  39.02 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  43.81 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  43.81 
 
 		 297 aa  220  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 		 310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  39.66 
 
 		 319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0015  methionyl-tRNA formyltransferase  44.52 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.229268 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4814  methionyl-tRNA formyltransferase  37.46 
 
 		 297 aa  219  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  43.24 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  40.4 
 
 		 326 aa  219  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 311 aa  219  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  38.56 
 
 		 320 aa  219  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0393  methionyl-tRNA formyltransferase  41.58 
 
 		 312 aa  219  7e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.894516  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  42.42 
 
 		 310 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  41.61 
 
 		 312 aa  218  8.999999999999998e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  41.31 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  41.69 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6477  methionyl-tRNA formyltransferase  42.17 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.79537 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  37.7 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  43.09 
 
 		 320 aa  217  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  42.37 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  42.42 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  39.02 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  43.95 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.98 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  41.5 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>