More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1548 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1548  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 332 aa  682    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1572  methionyl-tRNA formyltransferase  95.78 
 
 		 332 aa  656    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0883  methionyl-tRNA formyltransferase  68.09 
 
 		 334 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3481  methionyl-tRNA formyltransferase  65.76 
 
 		 334 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.902308 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  64.55 
 
 		 333 aa  449  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1769  methionyl-tRNA formyltransferase  65.05 
 
 		 336 aa  443  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.161248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3948  methionyl-tRNA formyltransferase  60.18 
 
 		 334 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2110  methionyl-tRNA formyltransferase  51.22 
 
 		 327 aa  341  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.6282 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  50.41 
 
 		 310 aa  256  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  39.88 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  41.95 
 
 		 315 aa  256  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  44.35 
 
 		 320 aa  255  7e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  40.12 
 
 		 311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  39.7 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  38.55 
 
 		 318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  38.25 
 
 		 318 aa  249  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  38.3 
 
 		 317 aa  249  6e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  42.64 
 
 		 318 aa  246  6e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  39.7 
 
 		 312 aa  241  9e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  43.12 
 
 		 329 aa  239  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1307  methionyl-tRNA formyltransferase  38.34 
 
 		 338 aa  239  5.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  38.25 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  38.86 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  38.14 
 
 		 309 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  37.84 
 
 		 319 aa  235  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  39.04 
 
 		 311 aa  235  8e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  41.74 
 
 		 314 aa  235  9e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  41.74 
 
 		 314 aa  235  9e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14401  putative methionyl-tRNA formyltransferase  35.8 
 
 		 342 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  40.49 
 
 		 312 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  40.87 
 
 		 316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1168  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 		 338 aa  233  3e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  42.37 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  38.18 
 
 		 311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  38.55 
 
 		 311 aa  232  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  42.37 
 
 		 318 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  42.37 
 
 		 318 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  39.88 
 
 		 317 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  42.37 
 
 		 318 aa  230  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  41.88 
 
 		 321 aa  229  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  41.12 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  37.27 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  37.85 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10281  putative methionyl-tRNA formyltransferase  36.39 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.477504  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10271  putative methionyl-tRNA formyltransferase  36.69 
 
 		 346 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  42.37 
 
 		 318 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  37.95 
 
 		 312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  42.15 
 
 		 313 aa  225  7e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  38.39 
 
 		 311 aa  225  8e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  41.43 
 
 		 318 aa  225  9e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  36.78 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  35.45 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  37.85 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  41.49 
 
 		 315 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  41.49 
 
 		 315 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  40.67 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0959  methionyl-tRNA formyltransferase  35.99 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.500083  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1005  methionyl-tRNA formyltransferase  35.95 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00554605  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  41.49 
 
 		 315 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  37.31 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  40.94 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  36.62 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  41.09 
 
 		 315 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  37.23 
 
 		 310 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  42.06 
 
 		 318 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  41.1 
 
 		 315 aa  222  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  42.06 
 
 		 318 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  37.92 
 
 		 314 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  42.06 
 
 		 318 aa  222  8e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  42.06 
 
 		 318 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  39.63 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  37.46 
 
 		 326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  41.49 
 
 		 315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  39.01 
 
 		 314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  41.44 
 
 		 315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  38.53 
 
 		 312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  37.31 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  40.96 
 
 		 312 aa  220  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0409  methionyl-tRNA formyltransferase  35.26 
 
 		 313 aa  220  3e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  41.88 
 
 		 320 aa  219  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  37.91 
 
 		 308 aa  219  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  36.14 
 
 		 319 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  40.25 
 
 		 315 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  39.22 
 
 		 315 aa  218  8.999999999999998e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  40.25 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.25 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.25 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  40.25 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  40.25 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  39.01 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  40.25 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  39.94 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  36.92 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  37.8 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  39.94 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  39.56 
 
 		 315 aa  216  5e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  36.36 
 
 		 314 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  36.78 
 
 		 310 aa  215  7e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>