More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1860 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1860  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 315 aa  638    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.346485  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1787  methionyl-tRNA formyltransferase  62.94 
 
 		 319 aa  411  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1678  methionyl-tRNA formyltransferase  63.23 
 
 		 318 aa  394  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0487  methionyl-tRNA formyltransferase  61.56 
 
 		 314 aa  389  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1472  methionyl-tRNA formyltransferase  59.93 
 
 		 314 aa  379  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  59.81 
 
 		 317 aa  361  7.0000000000000005e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793908 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  54.84 
 
 		 317 aa  349  3e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  47.28 
 
 		 320 aa  277  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  45.6 
 
 		 312 aa  257  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4814  methionyl-tRNA formyltransferase  45.03 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1921  hypothetical protein  41.86 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  41.78 
 
 		 302 aa  235  9e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.117163  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  44.01 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  39.17 
 
 		 310 aa  225  8e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  40.19 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  41.32 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  39.42 
 
 		 315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  39.81 
 
 		 317 aa  219  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  41.03 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  37.58 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  41.5 
 
 		 311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09618  methionyl-tRNA formyltransferase  39.16 
 
 		 315 aa  211  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315311  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  38.76 
 
 		 310 aa  208  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0138  methionyl-tRNA formyltransferase  38.51 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.483644  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  41.69 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  36.62 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  39.17 
 
 		 319 aa  206  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  37.26 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  37.26 
 
 		 318 aa  203  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  37.11 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  37.26 
 
 		 316 aa  203  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  39.02 
 
 		 311 aa  202  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  39.02 
 
 		 311 aa  202  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  36.94 
 
 		 313 aa  202  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  38.19 
 
 		 314 aa  199  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  34.71 
 
 		 312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  35.49 
 
 		 320 aa  195  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  35.65 
 
 		 315 aa  195  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1572  methionyl-tRNA formyltransferase  32.63 
 
 		 332 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2023  methionyl-tRNA formyltransferase  36.88 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.030686 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  34.38 
 
 		 316 aa  189  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  35.24 
 
 		 314 aa  188  9e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1548  methionyl-tRNA formyltransferase  32.63 
 
 		 332 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  36.62 
 
 		 311 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  35.87 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  37.34 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2110  methionyl-tRNA formyltransferase  34.85 
 
 		 327 aa  186  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.6282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  35.03 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  35.02 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  34.07 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  34.49 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  34.53 
 
 		 318 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  36.81 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  34.28 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  32.42 
 
 		 333 aa  178  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  34.18 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  33.86 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  33.86 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  33.86 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  33.86 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  34.7 
 
 		 314 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  34.7 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  33.23 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  36.88 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3948  methionyl-tRNA formyltransferase  34.32 
 
 		 334 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  36.25 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  33.54 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  32.28 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  35.56 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0787  methionyl-tRNA formyltransferase  33.44 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1514  methionyl-tRNA formyltransferase  35.74 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  36.39 
 
 		 319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  34.75 
 
 		 318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4113  methionyl-tRNA formyltransferase  37.99 
 
 		 312 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195925  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  34.7 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  35.06 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  32.9 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  33.77 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  36.45 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0883  methionyl-tRNA formyltransferase  31.75 
 
 		 334 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  35.6 
 
 		 330 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  33.65 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  36.09 
 
 		 310 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  35.06 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  34.19 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  35.24 
 
 		 309 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0817  methionyl-tRNA formyltransferase  36.16 
 
 		 316 aa  169  5e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  35.11 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  34.63 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  33.77 
 
 		 308 aa  169  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  35.81 
 
 		 314 aa  169  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  34.82 
 
 		 313 aa  169  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  34.74 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0164  methionyl-tRNA formyltransferase  33.12 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4080  methionyl-tRNA formyltransferase  37.34 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67477  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  32.37 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  35.67 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1005  methionyl-tRNA formyltransferase  33.75 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00554605  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1642  methionyl-tRNA formyltransferase  34.71 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2841  methionyl-tRNA formyltransferase  35.11 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>