More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0373 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0373  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 308 aa  613  1e-175  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  54.3 
 
 		 309 aa  334  1e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  45.57 
 
 		 319 aa  271  7e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  43.09 
 
 		 309 aa  267  2e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  41.25 
 
 		 315 aa  265  8e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  46.65 
 
 		 315 aa  263  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  39.6 
 
 		 312 aa  262  4e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  41.25 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  42.53 
 
 		 313 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  40.86 
 
 		 313 aa  257  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  42.14 
 
 		 314 aa  256  3e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  42.14 
 
 		 314 aa  256  3e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  39.6 
 
 		 317 aa  256  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 314 aa  256  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 		 311 aa  255  8e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 313 aa  254  9e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  40.58 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  43.67 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  38.83 
 
 		 311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  40.58 
 
 		 318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  41.95 
 
 		 310 aa  252  6e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  39.4 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  40.8 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  40.47 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  38.87 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  38.87 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  38.87 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  38.87 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  38.87 
 
 		 315 aa  249  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  38.87 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 311 aa  250  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 		 319 aa  249  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  38.96 
 
 		 311 aa  249  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 		 318 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  38.87 
 
 		 315 aa  249  6e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  38.54 
 
 		 315 aa  248  7e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  37.87 
 
 		 315 aa  248  9e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  40.73 
 
 		 316 aa  248  9e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  38.51 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  39.46 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  40.33 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  40.79 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 311 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 311 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  38.54 
 
 		 315 aa  245  6e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 		 321 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 		 315 aa  245  8e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  40.53 
 
 		 314 aa  245  8e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 		 315 aa  245  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 		 315 aa  245  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  39 
 
 		 318 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  40.74 
 
 		 319 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  37.21 
 
 		 310 aa  242  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  38.87 
 
 		 315 aa  242  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  38.21 
 
 		 315 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 		 311 aa  240  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  38.21 
 
 		 315 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  38.21 
 
 		 315 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  38.21 
 
 		 315 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  37.91 
 
 		 312 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  40.4 
 
 		 314 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  38.21 
 
 		 315 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  41.53 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 		 321 aa  239  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  38.21 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  38.54 
 
 		 314 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 		 319 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  38.67 
 
 		 318 aa  238  8e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  37.87 
 
 		 315 aa  238  9e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  37.97 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  38.21 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  37.87 
 
 		 310 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0036  methionyl-tRNA formyltransferase  37.99 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  40.4 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  39 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  39.4 
 
 		 314 aa  235  7e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  39.4 
 
 		 314 aa  235  9e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  39.4 
 
 		 314 aa  235  9e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  39.4 
 
 		 314 aa  235  9e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  39.4 
 
 		 314 aa  235  9e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  37.87 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  38.67 
 
 		 315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  39.07 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  39.4 
 
 		 314 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  34.77 
 
 		 318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  39.4 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  40.32 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  39.33 
 
 		 329 aa  233  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  39 
 
 		 320 aa  233  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  35.55 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  37.87 
 
 		 314 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  42.12 
 
 		 309 aa  232  5e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  37.21 
 
 		 314 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  36.21 
 
 		 307 aa  231  8.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  38.16 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>