More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0817 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0817  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 316 aa  645    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 311 aa  243  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  42.26 
 
 		 315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  43.61 
 
 		 311 aa  235  6e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  40.39 
 
 		 311 aa  235  7e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  43.18 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  40.39 
 
 		 318 aa  229  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 		 318 aa  228  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  43.93 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  41.69 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3065  methionyl-tRNA formyltransferase  41.29 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  41.75 
 
 		 315 aa  223  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  40.53 
 
 		 312 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  41.45 
 
 		 311 aa  222  7e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2841  methionyl-tRNA formyltransferase  39.41 
 
 		 334 aa  222  8e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  38.71 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  38.54 
 
 		 310 aa  219  7e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  41.04 
 
 		 318 aa  218  7.999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  39.24 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  40.51 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  41.23 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  41.23 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  42.35 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  36.51 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  39.81 
 
 		 317 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  40.79 
 
 		 317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2040  methionyl-tRNA formyltransferase  39.38 
 
 		 369 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  41.88 
 
 		 312 aa  215  5.9999999999999996e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  39.47 
 
 		 311 aa  215  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3694  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  39.41 
 
 		 313 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  38.76 
 
 		 319 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  41.69 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  38.29 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  40.39 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  40.26 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  37.82 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  37.34 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  37.46 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  36.04 
 
 		 315 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 312 aa  210  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  35.69 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  37.46 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 		 359 aa  210  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  37.01 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0806  methionyl-tRNA formyltransferase  41.83 
 
 		 310 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.283838 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  37.01 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  37.34 
 
 		 324 aa  209  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  39.54 
 
 		 308 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  42.02 
 
 		 316 aa  209  4e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  41.45 
 
 		 312 aa  209  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  39.23 
 
 		 314 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  37.91 
 
 		 315 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  37.91 
 
 		 315 aa  209  7e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  37.91 
 
 		 315 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  37.91 
 
 		 315 aa  209  7e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  37.91 
 
 		 315 aa  209  7e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1005  methionyl-tRNA formyltransferase  36.33 
 
 		 317 aa  208  8e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00554605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  37.58 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  36.69 
 
 		 318 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  40.51 
 
 		 314 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  39.41 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 		 313 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  36.28 
 
 		 314 aa  207  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  35.37 
 
 		 309 aa  207  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  37.58 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  37.25 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  37.01 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  39.09 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  37.91 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  38.39 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  36.74 
 
 		 319 aa  206  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  37.25 
 
 		 314 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  36.69 
 
 		 318 aa  207  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0497  methionyl-tRNA formyltransferase  40.79 
 
 		 317 aa  207  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 		 310 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  37.01 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  39.35 
 
 		 319 aa  205  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  41.75 
 
 		 325 aa  206  6e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  37.01 
 
 		 318 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  38.46 
 
 		 306 aa  205  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  38.36 
 
 		 322 aa  205  8e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  37.58 
 
 		 315 aa  205  9e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  39.03 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  40.52 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1467  methionyl-tRNA formyltransferase  39.42 
 
 		 306 aa  205  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0397972  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  39.29 
 
 		 311 aa  205  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  37.91 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  36.69 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  37.21 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0014  methionyl-tRNA formyltransferase  39.81 
 
 		 329 aa  203  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  36.89 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  41.36 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  37.91 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  38.49 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  35.29 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  38.39 
 
 		 310 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0138  methionyl-tRNA formyltransferase  37.38 
 
 		 315 aa  202  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.483644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>