More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1467 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1467  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 306 aa  595  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0397972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  45.75 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  45.81 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  44.92 
 
 		 318 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  41.83 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  41.83 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  41.8 
 
 		 311 aa  236  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  38.36 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  44.77 
 
 		 313 aa  232  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  46.41 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  45.81 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  41.97 
 
 		 311 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  41.12 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  41.12 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  42.35 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  44.52 
 
 		 308 aa  226  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0393  methionyl-tRNA formyltransferase  44.95 
 
 		 312 aa  226  4e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.894516  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  40.85 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0541  methionyl-tRNA formyltransferase  43.28 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.743734  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  41.67 
 
 		 309 aa  223  2e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  43.65 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  44.37 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  41.04 
 
 		 311 aa  222  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  39.68 
 
 		 314 aa  219  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 		 306 aa  218  7.999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  38.02 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  45.28 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  42.95 
 
 		 316 aa  216  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  42.12 
 
 		 306 aa  216  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3065  methionyl-tRNA formyltransferase  42.41 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  45.07 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  43.73 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0409  methionyl-tRNA formyltransferase  39.03 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  35.6 
 
 		 319 aa  212  7e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  38.98 
 
 		 320 aa  212  7e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  44.85 
 
 		 319 aa  211  9e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  38.14 
 
 		 318 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  38.46 
 
 		 318 aa  209  6e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0058  methionyl-tRNA formyltransferase  43.63 
 
 		 311 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  38.39 
 
 		 313 aa  209  7e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.691189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  43.79 
 
 		 310 aa  209  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  42.67 
 
 		 314 aa  208  9e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  41.18 
 
 		 323 aa  207  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  38.46 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  38.74 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0449  methionyl-tRNA formyltransferase  50.21 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353128  normal  0.364478 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  38.74 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  38.74 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  44.48 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  37.86 
 
 		 312 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  38.74 
 
 		 318 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  38.74 
 
 		 312 aa  205  7e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  44.85 
 
 		 325 aa  205  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  42.11 
 
 		 310 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3304  methionyl-tRNA formyltransferase  42.3 
 
 		 307 aa  205  8e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607232  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  41.1 
 
 		 312 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0817  methionyl-tRNA formyltransferase  39.42 
 
 		 316 aa  205  1e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  42.86 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  38.14 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  39.6 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.6 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  39.6 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  38.08 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  39.4 
 
 		 315 aa  203  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  39.27 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  44.26 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  42.14 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.6 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  39.6 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  36.88 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  42.33 
 
 		 310 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  39.07 
 
 		 315 aa  202  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  37.62 
 
 		 320 aa  202  7e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 		 322 aa  202  8e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1129  methionyl-tRNA formyltransferase  44.55 
 
 		 312 aa  201  9e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158103 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  36.89 
 
 		 318 aa  201  9e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  38.11 
 
 		 329 aa  201  9e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  39.4 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  41.27 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1777  methionyl-tRNA formyltransferase  37.46 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  39.07 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 		 320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  37.21 
 
 		 319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0075  methionyl-tRNA formyltransferase  42.68 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.716754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  37.29 
 
 		 318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  43.04 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0236  methionyl-tRNA formyltransferase  36 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  40.63 
 
 		 327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  36.27 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3859  methionyl-tRNA formyltransferase  40.62 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0831  methionyl-tRNA formyltransferase  41.72 
 
 		 327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2078  methionyl-tRNA formyltransferase  39.25 
 
 		 332 aa  199  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  37.01 
 
 		 312 aa  199  5e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  37.95 
 
 		 313 aa  198  9e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  39.37 
 
 		 311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  45.28 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  36.21 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>