More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0449 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0449  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
342 aa  664    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353128  normal  0.364478 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4113  methionyl-tRNA formyltransferase  75.4 
 
 
312 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195925  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  73.8 
 
 
312 aa  424  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159164  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4080  methionyl-tRNA formyltransferase  74.12 
 
 
312 aa  424  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67477  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  48.85 
 
 
317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  48.2 
 
 
311 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  48.38 
 
 
318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  50.65 
 
 
312 aa  273  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  48.52 
 
 
318 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  45.9 
 
 
313 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  41.88 
 
 
319 aa  251  9.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  45.03 
 
 
316 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  41.97 
 
 
310 aa  250  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  40.91 
 
 
312 aa  249  7e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  46.2 
 
 
311 aa  245  6.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  45.21 
 
 
311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 
312 aa  240  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  47.21 
 
 
359 aa  240  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  45.08 
 
 
315 aa  241  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  45.54 
 
 
313 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  41.25 
 
 
317 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  46.79 
 
 
310 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  45.51 
 
 
319 aa  239  5e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  44.52 
 
 
311 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  43.89 
 
 
315 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  41.12 
 
 
318 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  46.47 
 
 
310 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  46.95 
 
 
328 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  43.17 
 
 
320 aa  236  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  45.83 
 
 
310 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  43.13 
 
 
321 aa  235  9e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  39.26 
 
 
333 aa  235  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  45.51 
 
 
310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  43.13 
 
 
318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  45.51 
 
 
310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 
318 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  45.87 
 
 
318 aa  232  8.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  39.22 
 
 
314 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 
318 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  38.89 
 
 
314 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  38.89 
 
 
314 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  39.35 
 
 
314 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  38.89 
 
 
314 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  38.89 
 
 
314 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  38.89 
 
 
314 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  39.35 
 
 
314 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  39.22 
 
 
314 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  43.81 
 
 
329 aa  230  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  45.51 
 
 
330 aa  229  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 
318 aa  229  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0014  methionyl-tRNA formyltransferase  46.25 
 
 
329 aa  229  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0040  methionyl-tRNA formyltransferase  42.55 
 
 
317 aa  229  4e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3920  methionyl-tRNA formyltransferase  45.42 
 
 
325 aa  229  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  40.46 
 
 
309 aa  229  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  44.79 
 
 
314 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  38.56 
 
 
314 aa  229  7e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 
315 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 
315 aa  228  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  40.26 
 
 
312 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 
315 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  42.81 
 
 
315 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  40.85 
 
 
314 aa  228  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 
315 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 
315 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  43.08 
 
 
315 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  41.32 
 
 
312 aa  227  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  42.49 
 
 
315 aa  227  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 
315 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  37.06 
 
 
309 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 
315 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 
315 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 
315 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 
315 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 
315 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  43.13 
 
 
315 aa  226  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  44.87 
 
 
314 aa  226  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 
315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  44.3 
 
 
322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  43.13 
 
 
315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  42.17 
 
 
314 aa  226  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  36.84 
 
 
313 aa  225  9e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  41.96 
 
 
313 aa  225  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  42.49 
 
 
315 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  42.49 
 
 
315 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2139  methionyl-tRNA formyltransferase  41.85 
 
 
361 aa  223  3e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00931795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  43.79 
 
 
313 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  42.17 
 
 
315 aa  223  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2467  methionyl-tRNA formyltransferase  40.9 
 
 
363 aa  223  3e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0926432 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  42.49 
 
 
320 aa  223  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0831  methionyl-tRNA formyltransferase  46.15 
 
 
327 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  45.83 
 
 
314 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  40.58 
 
 
321 aa  223  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  43.61 
 
 
319 aa  222  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  42.38 
 
 
318 aa  222  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4638  methionyl-tRNA formyltransferase  43.67 
 
 
357 aa  222  9e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.857325  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  42.05 
 
 
318 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  39.34 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  45.43 
 
 
314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  42.05 
 
 
318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  43.42 
 
 
319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>