More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0016 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 322 aa  654    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0014  methionyl-tRNA formyltransferase  57.69 
 
 		 329 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  57.19 
 
 		 330 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2841  methionyl-tRNA formyltransferase  56.35 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2040  methionyl-tRNA formyltransferase  53.85 
 
 		 369 aa  354  1e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  46.89 
 
 		 310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  44.16 
 
 		 322 aa  252  5.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  44.98 
 
 		 311 aa  251  9.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  46.89 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  46.89 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  46.56 
 
 		 310 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  44.77 
 
 		 319 aa  250  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  46.95 
 
 		 310 aa  249  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  46.73 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  45.73 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.596014  normal  0.0248257 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  43.04 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  43.28 
 
 		 313 aa  245  8e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  45.98 
 
 		 314 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  41.99 
 
 		 316 aa  243  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  45.22 
 
 		 314 aa  242  7e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  44.82 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  46.95 
 
 		 314 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  42.24 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  41.16 
 
 		 318 aa  239  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  42.24 
 
 		 318 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  43 
 
 		 301 aa  239  5.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  43.04 
 
 		 315 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  42.57 
 
 		 318 aa  238  9e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  43.09 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  41.91 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  41.91 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  43.83 
 
 		 317 aa  236  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  39.56 
 
 		 326 aa  236  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  39.75 
 
 		 312 aa  236  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  42.38 
 
 		 324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  40.51 
 
 		 318 aa  235  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  39.82 
 
 		 320 aa  235  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  41.06 
 
 		 321 aa  235  8e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  41.88 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  42.21 
 
 		 314 aa  233  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0012  methionyl-tRNA formyltransferase  46.2 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  41.47 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  41.14 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2467  methionyl-tRNA formyltransferase  49.6 
 
 		 363 aa  233  3e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0926432 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0021  methionyl-tRNA formyltransferase  44.73 
 
 		 313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.223082 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  44.73 
 
 		 313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  52.77 
 
 		 311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  48.95 
 
 		 329 aa  232  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  42.62 
 
 		 315 aa  231  8.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  41.56 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  41.56 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  46.86 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  40.47 
 
 		 315 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 314 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  41.88 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  45.22 
 
 		 314 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  46.54 
 
 		 325 aa  230  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  43.18 
 
 		 308 aa  229  6e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  41.88 
 
 		 309 aa  229  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  40.98 
 
 		 315 aa  228  8e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.98 
 
 		 315 aa  228  8e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.98 
 
 		 315 aa  228  8e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  40.98 
 
 		 315 aa  228  8e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  48.12 
 
 		 319 aa  228  8e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  40.98 
 
 		 315 aa  228  8e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  38.76 
 
 		 317 aa  228  8e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  46.13 
 
 		 318 aa  228  8e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  40.66 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  40.98 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  39.94 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  41.39 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  40.26 
 
 		 311 aa  228  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  40.98 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  41.56 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  43.97 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  40.91 
 
 		 310 aa  227  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  42.86 
 
 		 308 aa  226  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  42.67 
 
 		 315 aa  226  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 		 311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  41.06 
 
 		 318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 315 aa  225  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  42.9 
 
 		 311 aa  226  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  40.66 
 
 		 315 aa  225  7e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  37.66 
 
 		 312 aa  225  7e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  41.88 
 
 		 302 aa  225  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  44.3 
 
 		 307 aa  225  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  42.67 
 
 		 315 aa  225  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  42.67 
 
 		 315 aa  225  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  42.67 
 
 		 315 aa  225  9e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  40.73 
 
 		 316 aa  224  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  42.04 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  42.21 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  42.21 
 
 		 307 aa  225  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  46.03 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  41.91 
 
 		 320 aa  225  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2139  methionyl-tRNA formyltransferase  48.15 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931795 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0393  methionyl-tRNA formyltransferase  43.83 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.894516  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  40.73 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>