More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0014 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0014  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 329 aa  669    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  62.92 
 
 		 330 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2040  methionyl-tRNA formyltransferase  62.61 
 
 		 369 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2841  methionyl-tRNA formyltransferase  60 
 
 		 334 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  57.69 
 
 		 322 aa  380  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  48.66 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  48.38 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  44.72 
 
 		 314 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  42.67 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  44.97 
 
 		 310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  46.08 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  46.1 
 
 		 319 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  48.12 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  46.08 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  45.75 
 
 		 314 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  51.65 
 
 		 332 aa  252  6e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  46.08 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  42.02 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  43.59 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  47.23 
 
 		 318 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  45.78 
 
 		 307 aa  248  7e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  43.14 
 
 		 316 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  43.67 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  45.34 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  43.67 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  53.02 
 
 		 325 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  43.95 
 
 		 319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  43.71 
 
 		 315 aa  245  8e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  43.38 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  42.57 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  43.89 
 
 		 348 aa  243  3e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.596014  normal  0.0248257 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  49.01 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  41.5 
 
 		 311 aa  243  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  43.38 
 
 		 315 aa  242  7e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  43.38 
 
 		 315 aa  242  7e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0012  methionyl-tRNA formyltransferase  46.81 
 
 		 337 aa  242  7e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  42.3 
 
 		 312 aa  242  7e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  43.38 
 
 		 315 aa  242  7e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  43.38 
 
 		 315 aa  242  7e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  43.38 
 
 		 315 aa  242  7e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  41.61 
 
 		 317 aa  241  9e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  43.05 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  43.38 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  43.62 
 
 		 321 aa  241  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  43.71 
 
 		 315 aa  241  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  44.34 
 
 		 301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  43.87 
 
 		 322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  47.73 
 
 		 320 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  42.52 
 
 		 313 aa  239  6.999999999999999e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 		 315 aa  238  8e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  42.28 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  43.33 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  43.19 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  41.91 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  41.91 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  41.91 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  38.7 
 
 		 319 aa  237  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  42.24 
 
 		 314 aa  236  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  42.52 
 
 		 329 aa  236  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  39.44 
 
 		 318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 312 aa  235  6e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  44.3 
 
 		 302 aa  235  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  44.3 
 
 		 320 aa  235  8e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  42.02 
 
 		 313 aa  235  9e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  45 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  42.67 
 
 		 311 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  41.03 
 
 		 320 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  43.3 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  43.46 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  44.3 
 
 		 302 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 		 315 aa  232  5e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  45.48 
 
 		 359 aa  233  5e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  43.3 
 
 		 314 aa  232  6e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  46.03 
 
 		 314 aa  232  6e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  41.86 
 
 		 321 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  43.59 
 
 		 328 aa  232  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  40.8 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  42.33 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  43.65 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  40.26 
 
 		 318 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  47.76 
 
 		 311 aa  231  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  40.86 
 
 		 318 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 318 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 318 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  44.3 
 
 		 302 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  46.25 
 
 		 297 aa  229  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 318 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  40.78 
 
 		 317 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  40.53 
 
 		 318 aa  229  7e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3877  methionyl-tRNA formyltransferase  42.86 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  38.46 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3859  methionyl-tRNA formyltransferase  41.59 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  40.53 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>