More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2841 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2841  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 334 aa  680    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0014  methionyl-tRNA formyltransferase  60 
 
 		 329 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2040  methionyl-tRNA formyltransferase  60.24 
 
 		 369 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  56.53 
 
 		 330 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  56.35 
 
 		 322 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  45.75 
 
 		 315 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  45.37 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  48.58 
 
 		 311 aa  263  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  43.97 
 
 		 317 aa  256  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  44.55 
 
 		 315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  44.79 
 
 		 310 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  41.21 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  43.14 
 
 		 311 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  44.22 
 
 		 315 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  44.22 
 
 		 315 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  44.22 
 
 		 315 aa  251  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  44.79 
 
 		 310 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  44.22 
 
 		 315 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  44.22 
 
 		 315 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  44.79 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  44.22 
 
 		 315 aa  249  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  43.89 
 
 		 315 aa  249  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  43.56 
 
 		 314 aa  249  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  46.05 
 
 		 310 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  44.48 
 
 		 318 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  44.97 
 
 		 319 aa  248  9e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 		 315 aa  248  9e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  44.48 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  45.98 
 
 		 313 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  44.48 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  41.04 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  43.89 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  44.15 
 
 		 318 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  44.85 
 
 		 318 aa  246  4e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  44.59 
 
 		 318 aa  246  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  41.32 
 
 		 310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  45.07 
 
 		 319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  43.56 
 
 		 315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  45.28 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  43.56 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  43.65 
 
 		 313 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  43.56 
 
 		 315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  43.56 
 
 		 315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  43.56 
 
 		 315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  44.63 
 
 		 321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 		 312 aa  242  6e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  45.02 
 
 		 359 aa  242  6e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  44.55 
 
 		 311 aa  242  7e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  41.5 
 
 		 316 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  44.22 
 
 		 315 aa  241  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  45.97 
 
 		 315 aa  241  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  42.95 
 
 		 318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  41.83 
 
 		 317 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  51.27 
 
 		 324 aa  239  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  43.29 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 		 314 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  43.75 
 
 		 314 aa  239  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  40.44 
 
 		 318 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  47.37 
 
 		 315 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  42.57 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  41.03 
 
 		 319 aa  237  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  43.2 
 
 		 348 aa  237  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.596014  normal  0.0248257 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  41.35 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  39.43 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  45.07 
 
 		 314 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  39.43 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  41.1 
 
 		 311 aa  236  4e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  42.95 
 
 		 318 aa  236  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  42.67 
 
 		 310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  43.56 
 
 		 315 aa  236  6e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  41.75 
 
 		 314 aa  235  9e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  44.27 
 
 		 316 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  43.67 
 
 		 320 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  51.07 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  42.72 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  41.09 
 
 		 329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  41.95 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  42.9 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  42.9 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  42.9 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  46.95 
 
 		 321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  47.12 
 
 		 325 aa  233  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  41.29 
 
 		 315 aa  232  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  42.11 
 
 		 322 aa  232  7.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  41.69 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  42.07 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  41.25 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  42.28 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  47.92 
 
 		 315 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  41.93 
 
 		 308 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  44.74 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  40.39 
 
 		 314 aa  229  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  41.03 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  41.69 
 
 		 311 aa  230  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  40.39 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  40.39 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  48.54 
 
 		 315 aa  229  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 		 312 aa  229  6e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>