More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0393 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 313 aa  633  1e-180  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.691189  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0409  methionyl-tRNA formyltransferase  94.23 
 
 		 313 aa  595  1e-169  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0236  methionyl-tRNA formyltransferase  54.37 
 
 		 303 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  50.66 
 
 		 319 aa  305  7e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0907  methionyl-tRNA formyltransferase  50.32 
 
 		 310 aa  285  5e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000822843  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 		 311 aa  249  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  42.41 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  42.41 
 
 		 318 aa  247  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  42.44 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  40.72 
 
 		 317 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  39.46 
 
 		 311 aa  235  8e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  39.66 
 
 		 313 aa  235  9e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  41.16 
 
 		 319 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  40.83 
 
 		 316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  39.09 
 
 		 315 aa  229  6e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  42.96 
 
 		 311 aa  228  9e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  41.78 
 
 		 308 aa  225  8e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  38.28 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  36.69 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  40.34 
 
 		 359 aa  223  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  38.08 
 
 		 319 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  38.03 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  38.24 
 
 		 317 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  38.24 
 
 		 312 aa  222  6e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  37.79 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 		 315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0597  methionyl-tRNA formyltransferase  39.46 
 
 		 309 aa  219  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.411489  normal  0.365023 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  38.13 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  39.33 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  39.33 
 
 		 315 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.33 
 
 		 315 aa  218  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  37.33 
 
 		 314 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2272  methionyl-tRNA formyltransferase  37.74 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775496 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  37.38 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  39 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  37.38 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.33 
 
 		 315 aa  218  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  39.33 
 
 		 315 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  37.67 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  38.67 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  39.33 
 
 		 315 aa  218  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  38.46 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  39.33 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  36.45 
 
 		 314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  37.12 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  37.34 
 
 		 312 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  38.89 
 
 		 311 aa  215  5.9999999999999996e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  37 
 
 		 324 aa  215  7e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  36.33 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  36.79 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  37.1 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1548  methionyl-tRNA formyltransferase  34.98 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  38.8 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  36.33 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  39 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  36.33 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  37.46 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  37.13 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  39 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  36.79 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  38.33 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  39.07 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  37.17 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  37.7 
 
 		 314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  38.33 
 
 		 315 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  38.33 
 
 		 315 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  38.33 
 
 		 315 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  38.33 
 
 		 315 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3920  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 		 325 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  39.94 
 
 		 314 aa  212  5.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  38.61 
 
 		 328 aa  212  5.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  36.79 
 
 		 310 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3948  methionyl-tRNA formyltransferase  39.2 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  37.79 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  37.66 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  36.12 
 
 		 319 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  38.19 
 
 		 313 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  38.01 
 
 		 333 aa  210  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1572  methionyl-tRNA formyltransferase  34.37 
 
 		 332 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  39.25 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  37.22 
 
 		 314 aa  209  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1467  methionyl-tRNA formyltransferase  38.39 
 
 		 306 aa  209  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0397972  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  37.67 
 
 		 313 aa  209  7e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  36.67 
 
 		 318 aa  208  9e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 		 332 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  36.45 
 
 		 314 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  36.67 
 
 		 318 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  38.96 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  36.33 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  36.67 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  35.97 
 
 		 312 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  36.3 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  36.94 
 
 		 322 aa  206  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  36.69 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  36.09 
 
 		 315 aa  206  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  37.33 
 
 		 329 aa  205  7e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  35.67 
 
 		 315 aa  205  9e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  41.05 
 
 		 330 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  38.91 
 
 		 314 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>