More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1368 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 309 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  78.57 
 
 		 309 aa  480  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  76.14 
 
 		 308 aa  457  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  72.4 
 
 		 310 aa  422  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  69.68 
 
 		 311 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  68.39 
 
 		 316 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  67.97 
 
 		 307 aa  397  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  68.61 
 
 		 310 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  70.39 
 
 		 311 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  64.52 
 
 		 315 aa  381  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  64.36 
 
 		 308 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  63.12 
 
 		 337 aa  375  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  62.15 
 
 		 324 aa  375  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  62.38 
 
 		 308 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  60.53 
 
 		 308 aa  357  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2350  methionyl-tRNA formyltransferase  63.31 
 
 		 313 aa  351  1e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  61.76 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  64.69 
 
 		 308 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  64.69 
 
 		 308 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0196795  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  64.69 
 
 		 308 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  60.91 
 
 		 315 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  61.11 
 
 		 310 aa  342  5e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  62.5 
 
 		 319 aa  341  1e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3730  methionyl-tRNA formyltransferase  61.72 
 
 		 310 aa  332  6e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132882  normal  0.0191381 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1722  methionyl-tRNA formyltransferase  59.87 
 
 		 318 aa  330  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000240612  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  60.47 
 
 		 307 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11435  methionyl-tRNA formyltransferase  59.67 
 
 		 312 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.406209 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  59.08 
 
 		 311 aa  324  1e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2567  methionyl-tRNA formyltransferase  60.6 
 
 		 311 aa  322  7e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296174  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  57.14 
 
 		 306 aa  317  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  55 
 
 		 306 aa  306  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  52.28 
 
 		 336 aa  299  4e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  57.19 
 
 		 306 aa  299  4e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  53.11 
 
 		 317 aa  298  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  55.95 
 
 		 311 aa  291  7e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1966  methionyl-tRNA formyltransferase  46.32 
 
 		 328 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  48.58 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  44.37 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  44.59 
 
 		 308 aa  223  4e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  44.84 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  40.26 
 
 		 312 aa  219  5e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 326 aa  219  6e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  44.92 
 
 		 297 aa  218  7e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  43.65 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  41.58 
 
 		 317 aa  216  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  42.35 
 
 		 312 aa  216  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10800  methionyl-tRNA formyltransferase  45.45 
 
 		 366 aa  215  5.9999999999999996e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0126989  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  43.32 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4814  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  38.61 
 
 		 311 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  42.05 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  42.67 
 
 		 302 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  39.29 
 
 		 304 aa  208  9e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  41.95 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  41.95 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  41.95 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  36.22 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  37.26 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  35.85 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  41.95 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  41.95 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  41.61 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  41.28 
 
 		 315 aa  206  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  39.81 
 
 		 313 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  40.27 
 
 		 316 aa  206  5e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 320 aa  205  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  41.28 
 
 		 315 aa  205  7e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  37.9 
 
 		 309 aa  205  8e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  43.97 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  37.05 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  38.28 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  44.14 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  40.32 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  41.06 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  41.28 
 
 		 315 aa  203  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  39.02 
 
 		 313 aa  202  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  41.06 
 
 		 310 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  40.88 
 
 		 315 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  40.88 
 
 		 315 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  40.88 
 
 		 315 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  40.88 
 
 		 315 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  40.88 
 
 		 315 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  46.12 
 
 		 318 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  43.1 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3920  methionyl-tRNA formyltransferase  38.83 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  39.35 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  36.01 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  40.73 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  40.73 
 
 		 311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  41.83 
 
 		 311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  37.13 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  38.61 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  38.82 
 
 		 315 aa  199  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  42.12 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  41.9 
 
 		 311 aa  200  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  43.28 
 
 		 299 aa  199  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  37.71 
 
 		 314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  43.01 
 
 		 314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>