More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3099 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 315 aa  616  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  66.03 
 
 		 308 aa  412  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  67.53 
 
 		 309 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  64.52 
 
 		 309 aa  381  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  64.33 
 
 		 310 aa  378  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  60.51 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  61.15 
 
 		 308 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  62.46 
 
 		 311 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  60.13 
 
 		 311 aa  360  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  58.6 
 
 		 308 aa  355  3.9999999999999996e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  60.97 
 
 		 310 aa  353  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  61.89 
 
 		 319 aa  352  5e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  60.77 
 
 		 307 aa  350  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  59.03 
 
 		 316 aa  348  7e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  60.13 
 
 		 309 aa  348  9e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  60.65 
 
 		 315 aa  345  5e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  57.1 
 
 		 337 aa  344  8.999999999999999e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1722  methionyl-tRNA formyltransferase  59.05 
 
 		 318 aa  329  3e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000240612  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  56.05 
 
 		 306 aa  325  5e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  54.85 
 
 		 324 aa  323  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  59.35 
 
 		 310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  56.69 
 
 		 311 aa  320  3e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  57.33 
 
 		 307 aa  317  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2567  methionyl-tRNA formyltransferase  57.79 
 
 		 311 aa  316  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296174  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3730  methionyl-tRNA formyltransferase  59.35 
 
 		 310 aa  315  4e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132882  normal  0.0191381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2350  methionyl-tRNA formyltransferase  55.73 
 
 		 313 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  57.74 
 
 		 308 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0196795  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  57.74 
 
 		 308 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  57.74 
 
 		 308 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  53.82 
 
 		 317 aa  305  7e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  54.25 
 
 		 306 aa  301  8.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11435  methionyl-tRNA formyltransferase  55.13 
 
 		 312 aa  297  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.406209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  58.69 
 
 		 306 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  55.84 
 
 		 311 aa  292  4e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  49.41 
 
 		 336 aa  292  6e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1966  methionyl-tRNA formyltransferase  45.85 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  46.39 
 
 		 327 aa  245  9e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10800  methionyl-tRNA formyltransferase  47.57 
 
 		 366 aa  233  4.0000000000000004e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0126989  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  42.26 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  39.03 
 
 		 315 aa  216  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  39.93 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  39.93 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  41.06 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  41.48 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  38.78 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  41.06 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  40.26 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  40.73 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.73 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  40.73 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  40.73 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.73 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  40.73 
 
 		 315 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  42.53 
 
 		 297 aa  212  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  36.45 
 
 		 316 aa  212  7e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  40.73 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  41.61 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  41.39 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  41.39 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  41.39 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  41.39 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  41.39 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  40.47 
 
 		 326 aa  209  6e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  39.94 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  37.1 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  38.46 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  42.21 
 
 		 310 aa  205  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  42.58 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  35.67 
 
 		 312 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  36.33 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  39.3 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  40.58 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3920  methionyl-tRNA formyltransferase  40.45 
 
 		 325 aa  203  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  38.08 
 
 		 312 aa  203  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  38.08 
 
 		 314 aa  202  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  37.09 
 
 		 314 aa  202  6e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  38.41 
 
 		 313 aa  202  8e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  35.14 
 
 		 314 aa  202  8e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  40.32 
 
 		 312 aa  201  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  37.09 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  33.99 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  37.22 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  34.95 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  42.26 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4814  methionyl-tRNA formyltransferase  36.18 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  40.91 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  36.57 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  39.07 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  41.61 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  40.91 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  37.22 
 
 		 312 aa  199  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  36.1 
 
 		 315 aa  199  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  38.08 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  39.81 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1921  hypothetical protein  37.62 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  37.09 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>