More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2825 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
309 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  78.57 
 
 
309 aa  480  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  73.95 
 
 
311 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  72.73 
 
 
308 aa  442  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  71.52 
 
 
310 aa  413  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  71.85 
 
 
310 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  68.3 
 
 
307 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  67.53 
 
 
315 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  69.48 
 
 
311 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  64.63 
 
 
316 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  63.61 
 
 
308 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  65.12 
 
 
308 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  62.77 
 
 
337 aa  375  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  63.46 
 
 
308 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  62.62 
 
 
309 aa  360  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  59.57 
 
 
324 aa  351  1e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3730  methionyl-tRNA formyltransferase  62.66 
 
 
310 aa  350  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132882  normal  0.0191381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  64.12 
 
 
308 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  64.12 
 
 
308 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0196795  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  64.12 
 
 
308 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  61.15 
 
 
315 aa  347  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2350  methionyl-tRNA formyltransferase  60.26 
 
 
313 aa  345  6e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  61.26 
 
 
310 aa  344  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  60 
 
 
319 aa  342  4e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  60.26 
 
 
306 aa  341  9e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1722  methionyl-tRNA formyltransferase  60.51 
 
 
318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000240612  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  58.9 
 
 
311 aa  335  7e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11435  methionyl-tRNA formyltransferase  59.93 
 
 
312 aa  324  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.406209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  58.25 
 
 
307 aa  321  8e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2567  methionyl-tRNA formyltransferase  59.47 
 
 
311 aa  316  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296174  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  58.19 
 
 
306 aa  314  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  52.11 
 
 
336 aa  310  2.9999999999999997e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  55 
 
 
306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  53.11 
 
 
317 aa  298  5e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  56.39 
 
 
311 aa  290  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1966  methionyl-tRNA formyltransferase  45.94 
 
 
328 aa  263  3e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  48.25 
 
 
327 aa  256  3e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10800  methionyl-tRNA formyltransferase  45.13 
 
 
366 aa  216  5e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0126989  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 
312 aa  211  9e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  43.48 
 
 
308 aa  210  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  44.16 
 
 
297 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  43.49 
 
 
319 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  36.33 
 
 
310 aa  206  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 
318 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  36.09 
 
 
326 aa  202  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  36.84 
 
 
311 aa  202  6e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  37.62 
 
 
311 aa  202  8e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  38.39 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  36.33 
 
 
312 aa  198  7.999999999999999e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  39.07 
 
 
310 aa  198  9e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  35.05 
 
 
314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  35.05 
 
 
314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  35.05 
 
 
314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  35.05 
 
 
314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 
312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  35.05 
 
 
314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  40.82 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  35.37 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  37.62 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  35.37 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  40.82 
 
 
315 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  40.82 
 
 
315 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  38.11 
 
 
316 aa  196  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  38.05 
 
 
314 aa  197  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  40.82 
 
 
315 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  40.82 
 
 
315 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  38.05 
 
 
314 aa  197  3e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  42.47 
 
 
310 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  37.1 
 
 
311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  37.3 
 
 
309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  39.49 
 
 
320 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  34.73 
 
 
314 aa  195  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 
314 aa  195  7e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 
315 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  35.39 
 
 
314 aa  195  8.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1921  hypothetical protein  37.84 
 
 
297 aa  195  8.000000000000001e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  35.05 
 
 
314 aa  195  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  33.23 
 
 
316 aa  195  9e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 
315 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 
315 aa  195  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  42.47 
 
 
310 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 
315 aa  194  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 
315 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  39.93 
 
 
301 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  39.8 
 
 
315 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  35.26 
 
 
314 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  39.93 
 
 
311 aa  195  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 
315 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  42.26 
 
 
307 aa  194  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  39.46 
 
 
315 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  42.12 
 
 
310 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  42.12 
 
 
310 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  39.55 
 
 
312 aa  193  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  42.63 
 
 
310 aa  193  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  40.33 
 
 
302 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  37.05 
 
 
304 aa  192  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  41.97 
 
 
310 aa  192  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0817  methionyl-tRNA formyltransferase  38.36 
 
 
316 aa  191  1e-47  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  41.78 
 
 
307 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  39.46 
 
 
315 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>