More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2575 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 308 aa  610  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  70.2 
 
 		 308 aa  421  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  68.21 
 
 		 308 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  61.89 
 
 		 308 aa  381  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  63.61 
 
 		 309 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  61.76 
 
 		 311 aa  364  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  63.73 
 
 		 309 aa  362  3e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  60.53 
 
 		 309 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  58.6 
 
 		 315 aa  355  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  61.06 
 
 		 310 aa  354  7.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  61.62 
 
 		 307 aa  352  4e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  60.73 
 
 		 310 aa  348  6e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  61.33 
 
 		 316 aa  347  1e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  59.16 
 
 		 311 aa  345  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2350  methionyl-tRNA formyltransferase  61.36 
 
 		 313 aa  335  7.999999999999999e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  57.05 
 
 		 337 aa  334  1e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  59.87 
 
 		 319 aa  330  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  60.54 
 
 		 308 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0196795  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  60.54 
 
 		 308 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  60.54 
 
 		 308 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  58.5 
 
 		 315 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  57.72 
 
 		 306 aa  325  4.0000000000000003e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3730  methionyl-tRNA formyltransferase  59.34 
 
 		 310 aa  325  5e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132882  normal  0.0191381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2567  methionyl-tRNA formyltransferase  58.63 
 
 		 311 aa  324  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296174  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  59.67 
 
 		 310 aa  324  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  54.78 
 
 		 324 aa  320  3e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  54.4 
 
 		 306 aa  315  6e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  57 
 
 		 306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  54.37 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  55.37 
 
 		 307 aa  300  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11435  methionyl-tRNA formyltransferase  55.78 
 
 		 312 aa  298  9e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.406209 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 336 aa  291  9e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1722  methionyl-tRNA formyltransferase  52.88 
 
 		 318 aa  291  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000240612  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  50.65 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  51.92 
 
 		 311 aa  272  5.000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1966  methionyl-tRNA formyltransferase  46.58 
 
 		 328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  44.9 
 
 		 318 aa  232  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  42.28 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  45.11 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  39.53 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10800  methionyl-tRNA formyltransferase  46.13 
 
 		 366 aa  219  3e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0126989  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  39.93 
 
 		 314 aa  218  7e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  38.85 
 
 		 314 aa  219  7e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  39.93 
 
 		 314 aa  218  7e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  41.98 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  38.94 
 
 		 314 aa  216  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  45.08 
 
 		 307 aa  215  7e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  41.3 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  38.82 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  41.33 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  45.02 
 
 		 307 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  40.27 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.27 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  40.27 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  40.27 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.27 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  40.27 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  38.05 
 
 		 311 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  38.94 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  38.98 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  39.93 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  39.93 
 
 		 315 aa  209  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  38.23 
 
 		 312 aa  209  7e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  41 
 
 		 302 aa  208  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  39.93 
 
 		 314 aa  208  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  45.27 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  39.45 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  42.12 
 
 		 319 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2272  methionyl-tRNA formyltransferase  41.69 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775496 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  43.54 
 
 		 307 aa  205  6e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  41.28 
 
 		 301 aa  205  6e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  38.18 
 
 		 311 aa  205  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  39.46 
 
 		 311 aa  205  8e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  40.8 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  43 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  39.25 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  37.17 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  41.31 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  42.47 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  45.53 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 		 302 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  37.88 
 
 		 315 aa  202  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  41.72 
 
 		 311 aa  201  9e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  42.41 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  41.98 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  37.66 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  41.98 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  38.31 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3304  methionyl-tRNA formyltransferase  43.05 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607232  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  42.33 
 
 		 313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  39.18 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  41.44 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  39.73 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  41.98 
 
 		 310 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  37.11 
 
 		 321 aa  199  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>