More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2048 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 311 aa  591  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  58.9 
 
 		 309 aa  335  7e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  58.52 
 
 		 319 aa  328  8e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  55.42 
 
 		 324 aa  325  5e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  58.47 
 
 		 308 aa  324  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  59.08 
 
 		 309 aa  324  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  60.13 
 
 		 308 aa  324  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  57.28 
 
 		 316 aa  323  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  56.69 
 
 		 315 aa  320  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  59.54 
 
 		 315 aa  318  9e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  54.37 
 
 		 308 aa  310  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  54.9 
 
 		 308 aa  308  9e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  56.44 
 
 		 310 aa  306  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  55.92 
 
 		 309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  54.74 
 
 		 337 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  56.77 
 
 		 308 aa  301  9e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  56.77 
 
 		 308 aa  301  9e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0196795  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  56.77 
 
 		 308 aa  301  9e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  57.05 
 
 		 311 aa  300  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  53.31 
 
 		 311 aa  299  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1722  methionyl-tRNA formyltransferase  55.35 
 
 		 318 aa  299  5e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000240612  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  54.19 
 
 		 310 aa  297  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  55.33 
 
 		 307 aa  296  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  54.52 
 
 		 307 aa  296  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11435  methionyl-tRNA formyltransferase  56.07 
 
 		 312 aa  294  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.406209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  55.12 
 
 		 310 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2567  methionyl-tRNA formyltransferase  54.34 
 
 		 311 aa  290  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296174  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3730  methionyl-tRNA formyltransferase  55.96 
 
 		 310 aa  288  9e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132882  normal  0.0191381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2350  methionyl-tRNA formyltransferase  55.13 
 
 		 313 aa  288  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  54.85 
 
 		 306 aa  285  5e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  55.81 
 
 		 306 aa  282  6.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  51.45 
 
 		 317 aa  279  4e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  55.7 
 
 		 306 aa  279  4e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  48.05 
 
 		 336 aa  273  2.0000000000000002e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1966  methionyl-tRNA formyltransferase  46.89 
 
 		 328 aa  256  2e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  51.92 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  44.06 
 
 		 327 aa  218  7e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  41.2 
 
 		 301 aa  218  8.999999999999998e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  41.69 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  41.69 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  41.69 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  41.69 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  42.71 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  41.69 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  41.69 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  40.61 
 
 		 315 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  41.69 
 
 		 315 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  42.71 
 
 		 315 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  42.71 
 
 		 315 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  42.71 
 
 		 315 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  42.71 
 
 		 315 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  41.36 
 
 		 315 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  41.3 
 
 		 315 aa  209  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  41.36 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10800  methionyl-tRNA formyltransferase  46.43 
 
 		 366 aa  206  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0126989  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  45.08 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  203  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  44.67 
 
 		 302 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  38.56 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  38.56 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  38.56 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  40.46 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  38.51 
 
 		 312 aa  198  9e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 		 312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  38.91 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  38.87 
 
 		 314 aa  196  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  35.64 
 
 		 314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  38.56 
 
 		 310 aa  196  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  33.65 
 
 		 314 aa  195  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  38.7 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  44.44 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  41.12 
 
 		 310 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  42.76 
 
 		 310 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  41.46 
 
 		 310 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  36.77 
 
 		 312 aa  192  5e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  39.22 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  41 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  36.67 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  37.88 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  34.65 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  35.37 
 
 		 318 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  41.1 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  33.77 
 
 		 314 aa  189  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  42.05 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  33.44 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  43.44 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  39.72 
 
 		 310 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  33.44 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  33.44 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  35.15 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  40.14 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  33.44 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  33.44 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  38.23 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>