More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1665 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
306 aa  597  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  81.05 
 
 
306 aa  463  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  57 
 
 
308 aa  318  7.999999999999999e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  54.52 
 
 
308 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  54.4 
 
 
308 aa  315  6e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  55.7 
 
 
308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  55 
 
 
309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1722  methionyl-tRNA formyltransferase  55.96 
 
 
318 aa  306  3e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000240612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  55 
 
 
309 aa  306  3e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  56.17 
 
 
319 aa  306  3e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  54.72 
 
 
310 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  54.25 
 
 
315 aa  301  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  54.79 
 
 
307 aa  300  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  56.67 
 
 
315 aa  298  9e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  55.81 
 
 
310 aa  296  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  54.15 
 
 
311 aa  295  5e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  53.49 
 
 
316 aa  292  6e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  54.72 
 
 
306 aa  291  8e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  50.62 
 
 
336 aa  285  5.999999999999999e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  49.24 
 
 
324 aa  285  9e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  50.81 
 
 
317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  55.81 
 
 
311 aa  282  6.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  53.02 
 
 
307 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  51.48 
 
 
309 aa  280  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2350  methionyl-tRNA formyltransferase  53.67 
 
 
313 aa  278  7e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 
337 aa  276  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  52.98 
 
 
311 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  52 
 
 
310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  54.49 
 
 
311 aa  271  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11435  methionyl-tRNA formyltransferase  51.16 
 
 
312 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.406209 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2567  methionyl-tRNA formyltransferase  51.47 
 
 
311 aa  262  6e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296174  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3730  methionyl-tRNA formyltransferase  50.67 
 
 
310 aa  259  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132882  normal  0.0191381 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10800  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 
366 aa  255  6e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0126989  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  50.84 
 
 
308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0196795  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  50.84 
 
 
308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  50.84 
 
 
308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1966  methionyl-tRNA formyltransferase  44.79 
 
 
328 aa  238  1e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  46.96 
 
 
327 aa  236  4e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  44.55 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  42.57 
 
 
308 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  39.5 
 
 
320 aa  206  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  44.59 
 
 
310 aa  205  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  42.57 
 
 
302 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  44.7 
 
 
310 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  42.24 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  42.28 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  41.61 
 
 
302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  40.47 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  42.47 
 
 
310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  42.33 
 
 
312 aa  198  9e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  40.27 
 
 
318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  38.33 
 
 
311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  41.08 
 
 
315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  40.74 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.74 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  40.74 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  40.74 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  40.74 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.74 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  40.47 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  40.4 
 
 
315 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  40.94 
 
 
308 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  38.13 
 
 
315 aa  196  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  41.41 
 
 
315 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  39.93 
 
 
359 aa  195  7e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0164  methionyl-tRNA formyltransferase  42 
 
 
313 aa  195  9e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534579  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  36.95 
 
 
308 aa  194  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  41.08 
 
 
315 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  41.08 
 
 
315 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  41.08 
 
 
315 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  41.08 
 
 
315 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  37.12 
 
 
311 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  40.4 
 
 
315 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4832  methionyl-tRNA formyltransferase  37.91 
 
 
306 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000322713  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1921  hypothetical protein  37.88 
 
 
297 aa  193  3e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  38.54 
 
 
318 aa  193  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  37.83 
 
 
312 aa  192  7e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  37.33 
 
 
317 aa  191  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  37.87 
 
 
318 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  35 
 
 
314 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  35.31 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  39.32 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  39.32 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  38.13 
 
 
312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  39.32 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  41.47 
 
 
307 aa  189  4e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  39.4 
 
 
312 aa  189  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0597  methionyl-tRNA formyltransferase  37.25 
 
 
309 aa  188  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.411489  normal  0.365023 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  38.59 
 
 
315 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  41.14 
 
 
307 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  36.48 
 
 
312 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  37.79 
 
 
323 aa  186  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  38.64 
 
 
314 aa  185  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  35.88 
 
 
314 aa  185  9e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  35.88 
 
 
314 aa  185  9e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  34.33 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  34.33 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  34.33 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  41.14 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>