More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1005 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1005  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 317 aa  634    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00554605  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  53.48 
 
 		 309 aa  345  5e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  53.8 
 
 		 309 aa  344  1e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  44.65 
 
 		 311 aa  295  5e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  45.74 
 
 		 310 aa  281  9e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  44.3 
 
 		 312 aa  280  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  43.04 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  42.22 
 
 		 319 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  41.82 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  43.4 
 
 		 311 aa  266  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  42.45 
 
 		 313 aa  263  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  41.51 
 
 		 318 aa  261  8e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  41.19 
 
 		 318 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  43.08 
 
 		 317 aa  255  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  41.8 
 
 		 319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  40.67 
 
 		 320 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3481  methionyl-tRNA formyltransferase  39.09 
 
 		 334 aa  245  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.902308 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  42.22 
 
 		 311 aa  242  7e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  39.54 
 
 		 320 aa  241  9e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  42.39 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  39.22 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  39.22 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  38.8 
 
 		 359 aa  239  4e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  39.18 
 
 		 319 aa  239  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  39.22 
 
 		 318 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  39.22 
 
 		 318 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  39.22 
 
 		 318 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  41.25 
 
 		 312 aa  238  8e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  39.22 
 
 		 318 aa  238  9e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  36.66 
 
 		 318 aa  237  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  39.22 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  39.22 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  38.89 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  37.93 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  38.75 
 
 		 318 aa  236  4e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  38.49 
 
 		 311 aa  235  6e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  36.39 
 
 		 328 aa  235  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  38.89 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  35.62 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  35.99 
 
 		 313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  37.86 
 
 		 315 aa  232  5e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  37.81 
 
 		 321 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  39.48 
 
 		 314 aa  231  8.000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  39.48 
 
 		 314 aa  231  8.000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  41.08 
 
 		 315 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  36.88 
 
 		 329 aa  231  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  35.31 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  38.92 
 
 		 333 aa  229  3e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 314 aa  229  5e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  42.24 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  36.01 
 
 		 312 aa  226  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1548  methionyl-tRNA formyltransferase  35.95 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2110  methionyl-tRNA formyltransferase  36 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.6282 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  36.76 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  39.5 
 
 		 314 aa  223  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  37.1 
 
 		 313 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  39.81 
 
 		 314 aa  222  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  38.59 
 
 		 316 aa  221  9e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0883  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 		 334 aa  221  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  39.25 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  39.5 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  39.5 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  39.5 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  38.92 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  39.5 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  37.58 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  38.54 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  39.81 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  39.81 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  39.18 
 
 		 314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  35.94 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3948  methionyl-tRNA formyltransferase  37.35 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  35.78 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  36.13 
 
 		 311 aa  220  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  37.74 
 
 		 314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  36.45 
 
 		 314 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  34.52 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  34.5 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  36.57 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  36.77 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  36.05 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  36.77 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  36.57 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  36.01 
 
 		 307 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  36.77 
 
 		 310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  38.64 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  35.81 
 
 		 307 aa  216  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  36.68 
 
 		 319 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  35.81 
 
 		 314 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1572  methionyl-tRNA formyltransferase  34.14 
 
 		 332 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  35.69 
 
 		 307 aa  215  7e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  37.06 
 
 		 310 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  36.99 
 
 		 320 aa  215  9e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  38.56 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1769  methionyl-tRNA formyltransferase  37.92 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.161248  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  37.06 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  37.06 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>