More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2842 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2842  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 337 aa  666    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.409607  normal  0.026297 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  39.56 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  40.58 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  35.22 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 310 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  39.54 
 
 		 310 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 310 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  39.54 
 
 		 310 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  41.33 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  38.51 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  39.16 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  38.39 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 		 319 aa  199  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 		 310 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  39.62 
 
 		 318 aa  198  9e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  41.04 
 
 		 314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  36.99 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  38.06 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 		 318 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  37.97 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  39.09 
 
 		 307 aa  196  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  36.42 
 
 		 312 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  37.15 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  38.66 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3123  methionyl-tRNA formyltransferase  38.96 
 
 		 327 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.760657  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  37.15 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  37.15 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  36.84 
 
 		 318 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  38.39 
 
 		 318 aa  193  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  39.29 
 
 		 313 aa  192  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  39.34 
 
 		 314 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0072  methionyl-tRNA formyltransferase  38.91 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0065  methionyl-tRNA formyltransferase  35.42 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  35.74 
 
 		 312 aa  192  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  36.68 
 
 		 315 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  41.31 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0409  methionyl-tRNA formyltransferase  36.39 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  37.22 
 
 		 329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  36.69 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  35.76 
 
 		 316 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  36.48 
 
 		 311 aa  188  9e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3181  methionyl-tRNA formyltransferase  38.51 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  35.42 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  33.77 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  34.84 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  37.91 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  37.3 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  37.91 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  35.71 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  37.91 
 
 		 307 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3064  methionyl-tRNA formyltransferase  38.62 
 
 		 327 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  34.09 
 
 		 321 aa  187  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  39.94 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  37.58 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  37.74 
 
 		 324 aa  186  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  37.91 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0129  methionyl-tRNA formyltransferase  39.29 
 
 		 328 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  37.46 
 
 		 315 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  37.91 
 
 		 315 aa  186  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  37.46 
 
 		 315 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  37.46 
 
 		 315 aa  186  6e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2729  methionyl-tRNA formyltransferase  36.39 
 
 		 334 aa  186  7e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  37.25 
 
 		 315 aa  186  7e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  34.77 
 
 		 332 aa  186  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  37.46 
 
 		 313 aa  185  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  38.56 
 
 		 310 aa  185  8e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  36.74 
 
 		 311 aa  185  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  37.39 
 
 		 327 aa  185  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  37.58 
 
 		 315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  37.58 
 
 		 315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  34.42 
 
 		 314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  34.42 
 
 		 314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  34.17 
 
 		 311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  37.58 
 
 		 315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  37.58 
 
 		 315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  37.58 
 
 		 315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  38.05 
 
 		 320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3142  methionyl-tRNA formyltransferase  37.8 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  36.77 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  38.19 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  36.08 
 
 		 313 aa  183  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.691189  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 		 312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  35.33 
 
 		 318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  37.13 
 
 		 314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0393  methionyl-tRNA formyltransferase  36.68 
 
 		 312 aa  182  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.894516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  34.17 
 
 		 318 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  36.77 
 
 		 319 aa  182  6e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  37.25 
 
 		 315 aa  182  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  37.13 
 
 		 315 aa  182  7e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  34.52 
 
 		 314 aa  182  8.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  37.3 
 
 		 310 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  35.71 
 
 		 322 aa  182  9.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2139  methionyl-tRNA formyltransferase  36.04 
 
 		 361 aa  181  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931795 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  37.08 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6477  methionyl-tRNA formyltransferase  37.58 
 
 		 327 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.79537 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2040  methionyl-tRNA formyltransferase  37.31 
 
 		 369 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>