More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2183 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2183  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 318 aa  643    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0164  methionyl-tRNA formyltransferase  68.61 
 
 		 313 aa  421  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2291  methionyl-tRNA formyltransferase  52.3 
 
 		 319 aa  270  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  43.37 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2110  methionyl-tRNA formyltransferase  43.34 
 
 		 327 aa  233  5e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.6282 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  40.45 
 
 		 317 aa  232  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  41.56 
 
 		 311 aa  232  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 		 318 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  42.26 
 
 		 311 aa  230  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  41.75 
 
 		 313 aa  228  8e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  42.53 
 
 		 312 aa  225  6e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  44.22 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  38.51 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  44.22 
 
 		 302 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  42.58 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  42.62 
 
 		 301 aa  221  9e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  41.94 
 
 		 359 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  40.31 
 
 		 320 aa  220  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3920  methionyl-tRNA formyltransferase  43.77 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  43.96 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  38.14 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  43.23 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  42.62 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  38.39 
 
 		 314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  43.04 
 
 		 308 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 317 aa  215  8e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  36.57 
 
 		 311 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  40.51 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  41.83 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  37.21 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  39.3 
 
 		 312 aa  212  7.999999999999999e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  40.58 
 
 		 316 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  42.52 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  36.97 
 
 		 333 aa  209  5e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  42.19 
 
 		 307 aa  209  5e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 310 aa  209  7e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  42.53 
 
 		 305 aa  209  7e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  42.19 
 
 		 328 aa  208  8e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  43.95 
 
 		 310 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  41.03 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0449  methionyl-tRNA formyltransferase  42.86 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353128  normal  0.364478 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  41.75 
 
 		 318 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 313 aa  206  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  42.28 
 
 		 297 aa  206  6e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  40.91 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  40.51 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  40.86 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3481  methionyl-tRNA formyltransferase  38.37 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.902308 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1769  methionyl-tRNA formyltransferase  40.12 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.161248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  43.52 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  40.66 
 
 		 306 aa  203  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  39.76 
 
 		 320 aa  202  8e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  43.41 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  41.86 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  39.68 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  40.33 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  41.86 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  41.86 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  41.86 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  39.17 
 
 		 318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  41.86 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  39.6 
 
 		 308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0883  methionyl-tRNA formyltransferase  37.13 
 
 		 334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  39.17 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  40.72 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  40.33 
 
 		 315 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.33 
 
 		 315 aa  199  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  40.33 
 
 		 315 aa  199  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.33 
 
 		 315 aa  199  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  40.33 
 
 		 315 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1642  methionyl-tRNA formyltransferase  40.78 
 
 		 312 aa  199  6e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  199  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  38.54 
 
 		 318 aa  199  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  35.67 
 
 		 348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.596014  normal  0.0248257 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1524  methionyl-tRNA formyltransferase  40.45 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  40.98 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  40.06 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  42.63 
 
 		 319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  38.54 
 
 		 318 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  38.54 
 
 		 318 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  40.32 
 
 		 308 aa  195  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  38.54 
 
 		 318 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  38.83 
 
 		 312 aa  195  9e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  40.53 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  38.22 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 315 aa  195  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  35.83 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 307 aa  195  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0597  methionyl-tRNA formyltransferase  41.06 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.411489  normal  0.365023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  39.07 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  39.07 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  39.07 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>