More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2110 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2110  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 327 aa  646    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.6282 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  53.37 
 
 		 333 aa  360  1e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3481  methionyl-tRNA formyltransferase  54.35 
 
 		 334 aa  354  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.902308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1548  methionyl-tRNA formyltransferase  51.22 
 
 		 332 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1572  methionyl-tRNA formyltransferase  51.38 
 
 		 332 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3948  methionyl-tRNA formyltransferase  54.08 
 
 		 334 aa  348  6e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1769  methionyl-tRNA formyltransferase  52.44 
 
 		 336 aa  342  5.999999999999999e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.161248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0883  methionyl-tRNA formyltransferase  52.11 
 
 		 334 aa  341  9e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  41.8 
 
 		 310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  44.34 
 
 		 316 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 		 311 aa  255  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  43.43 
 
 		 315 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  43.96 
 
 		 319 aa  250  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  41.67 
 
 		 318 aa  248  8e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  41.36 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  42.06 
 
 		 312 aa  245  8e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  45.94 
 
 		 318 aa  245  9e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  41.34 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1307  methionyl-tRNA formyltransferase  45.28 
 
 		 338 aa  243  3e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  45.62 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  41.36 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  45.62 
 
 		 318 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  44.1 
 
 		 359 aa  242  5e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10281  putative methionyl-tRNA formyltransferase  36.54 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.477504  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  39.32 
 
 		 309 aa  239  4e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14401  putative methionyl-tRNA formyltransferase  43.93 
 
 		 342 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  45 
 
 		 318 aa  238  8e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10271  putative methionyl-tRNA formyltransferase  35.96 
 
 		 346 aa  238  9e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  45 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  39.01 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  44.83 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  44.38 
 
 		 318 aa  236  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  44.79 
 
 		 329 aa  236  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  44.69 
 
 		 318 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  40.61 
 
 		 317 aa  236  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0959  methionyl-tRNA formyltransferase  35.26 
 
 		 328 aa  235  9e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.500083  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  44.69 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  42.5 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  42.27 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  39.51 
 
 		 311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  45.79 
 
 		 313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  44.51 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  44.83 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  45.17 
 
 		 314 aa  232  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  43.93 
 
 		 318 aa  232  6e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  44.92 
 
 		 315 aa  232  6e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0164  methionyl-tRNA formyltransferase  41.9 
 
 		 313 aa  231  9e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1168  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 338 aa  231  1e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  37.96 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  33.95 
 
 		 309 aa  230  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  45.96 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  45.96 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  45.96 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  43.61 
 
 		 310 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  46.13 
 
 		 315 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  46.13 
 
 		 315 aa  229  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  37.31 
 
 		 316 aa  229  5e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  46.13 
 
 		 315 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  46.13 
 
 		 315 aa  229  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  46.13 
 
 		 315 aa  229  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 		 318 aa  229  7e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  45.51 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  45 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  45.82 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1005  methionyl-tRNA formyltransferase  35.52 
 
 		 317 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00554605  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  43.3 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  45.65 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  42.99 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  45.65 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  45.82 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  45.65 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  45.65 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  45.82 
 
 		 315 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  43.3 
 
 		 310 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0366  methionyl-tRNA formyltransferase  37.98 
 
 		 336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  41.59 
 
 		 332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  44.2 
 
 		 324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  43.92 
 
 		 319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  43.12 
 
 		 314 aa  225  7e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10481  putative methionyl-tRNA formyltransferase  37.98 
 
 		 336 aa  225  9e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.360492  hitchhiker  0.00290754 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  45.17 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  43.34 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2183  methionyl-tRNA formyltransferase  42.41 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  45.51 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  43.22 
 
 		 320 aa  223  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  42.45 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  36.39 
 
 		 312 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  43.3 
 
 		 315 aa  222  4.9999999999999996e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2139  methionyl-tRNA formyltransferase  38.37 
 
 		 361 aa  222  7e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931795 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  39.18 
 
 		 309 aa  222  8e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  38.74 
 
 		 314 aa  222  8e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  42.19 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  40.67 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09241  putative methionyl-tRNA formyltransferase  37.09 
 
 		 339 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0403377  hitchhiker  0.00000992021 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  43.34 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  34.26 
 
 		 311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  43.75 
 
 		 314 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2467  methionyl-tRNA formyltransferase  37.39 
 
 		 363 aa  219  5e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0926432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>