More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0164 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0164  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 313 aa  628  1e-179  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2183  methionyl-tRNA formyltransferase  68.61 
 
 		 318 aa  403  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2291  methionyl-tRNA formyltransferase  54.06 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  41.1 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  43.69 
 
 		 318 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  43.69 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  45.42 
 
 		 302 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  45.42 
 
 		 302 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  43.23 
 
 		 302 aa  235  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  42.53 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  40.45 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  38.89 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  42.48 
 
 		 308 aa  230  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2110  methionyl-tRNA formyltransferase  41.59 
 
 		 327 aa  228  8e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.6282 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  40.65 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  41.1 
 
 		 313 aa  225  6e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  43 
 
 		 308 aa  225  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  41.23 
 
 		 316 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  35.28 
 
 		 311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  41.42 
 
 		 312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  43.14 
 
 		 301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  41.1 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  42.48 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  40.65 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 317 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  43.13 
 
 		 310 aa  216  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  39.48 
 
 		 317 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  41.18 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  42.41 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  41.53 
 
 		 310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  43.14 
 
 		 297 aa  213  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  39.12 
 
 		 315 aa  212  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  40.72 
 
 		 312 aa  212  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3920  methionyl-tRNA formyltransferase  41.99 
 
 		 325 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  40.85 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  44.52 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  40.73 
 
 		 306 aa  209  6e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  38.06 
 
 		 314 aa  209  6e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  41.33 
 
 		 311 aa  208  7e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  36.12 
 
 		 310 aa  208  8e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  40.73 
 
 		 306 aa  208  8e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  41.06 
 
 		 308 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  40.57 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  39.47 
 
 		 318 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  42.39 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  39.47 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  41.72 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0597  methionyl-tRNA formyltransferase  42.86 
 
 		 309 aa  206  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.411489  normal  0.365023 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  40.46 
 
 		 307 aa  205  8e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  36.33 
 
 		 312 aa  205  8e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  42.62 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  35.79 
 
 		 311 aa  205  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  39.17 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  40.33 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  35.79 
 
 		 311 aa  205  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  39.47 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  38.49 
 
 		 318 aa  203  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  37.95 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  43.14 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  39.17 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  39.17 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1412  methionyl-tRNA formyltransferase  35.39 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  36.24 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.117163  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 		 318 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  40.86 
 
 		 315 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.86 
 
 		 315 aa  202  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  40.86 
 
 		 315 aa  202  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.86 
 
 		 315 aa  202  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  40.86 
 
 		 315 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  40.53 
 
 		 315 aa  201  9e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  40.86 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  38.91 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  40.53 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  38.21 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  40.58 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  33.88 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  42.47 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3304  methionyl-tRNA formyltransferase  42.39 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607232  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  34.92 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  33.55 
 
 		 309 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  40.53 
 
 		 315 aa  198  7.999999999999999e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  35.56 
 
 		 314 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  35.56 
 
 		 314 aa  198  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  35.56 
 
 		 314 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  35.56 
 
 		 314 aa  198  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  35.13 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  35.56 
 
 		 314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  35.24 
 
 		 314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3123  methionyl-tRNA formyltransferase  37.85 
 
 		 327 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.760657  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  38.91 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0806  methionyl-tRNA formyltransferase  41.25 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.283838 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0449  methionyl-tRNA formyltransferase  42.43 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353128  normal  0.364478 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0541  methionyl-tRNA formyltransferase  39.05 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.743734  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  41.22 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  35.56 
 
 		 314 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  35.56 
 
 		 314 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  41.22 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>