More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1485 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2975  AAA ATPase central domain protein  68.19 
 
 
592 aa  732    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00499196  normal  0.0176892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1838  AAA ATPase central domain-containing protein  71.19 
 
 
587 aa  766    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12147  ATPase  66.36 
 
 
609 aa  725    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4882  ATPase central domain-containing protein  67.92 
 
 
601 aa  725    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000159946  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20900  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit  78.55 
 
 
581 aa  849    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2458  AAA ATPase central domain protein  65.47 
 
 
607 aa  712    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.839877  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2231  AAA ATPase central domain protein  68.54 
 
 
599 aa  733    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377087  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1916  AAA ATPase central domain protein  66.3 
 
 
583 aa  729    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000404322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2241  ATPase central domain-containing protein  68.94 
 
 
593 aa  721    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451188  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5891  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit- like protein  69.3 
 
 
587 aa  741    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0900472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2242  AAA ATPase central domain protein  72.96 
 
 
560 aa  784    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2153  AAA ATPase central domain protein  67.03 
 
 
573 aa  720    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145525  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1809  vesicle-fusing ATPase  71.32 
 
 
584 aa  748    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2678  AAA ATPase central domain protein  70.49 
 
 
593 aa  734    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191022  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1201  AAA ATPase central domain protein  69.65 
 
 
550 aa  721    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.226586  normal  0.53529 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0907  AAA ATPase central domain protein  62.95 
 
 
579 aa  658    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.205473  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2630  vesicle-fusing ATPase  66.42 
 
 
602 aa  713    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.609425  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2423  AAA ATPase central domain protein  69.48 
 
 
594 aa  746    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407785  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2004  AAA ATPase central domain protein  82.14 
 
 
544 aa  845    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36132  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3132  vesicle-fusing ATPase  66.3 
 
 
615 aa  729    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.594904  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22080  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit  68.89 
 
 
602 aa  748    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2173  vesicle-fusing ATPase  66.48 
 
 
594 aa  729    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0532603  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4472  AAA ATPase central domain-containing protein  66.37 
 
 
596 aa  714    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.163487 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1184  vesicle-fusing ATPase  70.22 
 
 
583 aa  753    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.89835  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1486  AAA ATPase central domain protein  68.42 
 
 
586 aa  720    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178945  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3144  vesicle-fusing ATPase  66.3 
 
 
615 aa  729    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.844624 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2639  vesicle-fusing ATPase  68.97 
 
 
584 aa  738    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.774976  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1485  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
543 aa  1095    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3194  vesicle-fusing ATPase  66.3 
 
 
615 aa  729    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176841  normal  0.0401396 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2307  AAA ATPase central domain protein  69.87 
 
 
587 aa  743    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000305444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3458  vesicle-fusing ATPase  65.82 
 
 
615 aa  726    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3069  vesicle-fusing ATPase  64.45 
 
 
615 aa  725    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291044  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1866  AAA ATPase central domain protein  75.24 
 
 
578 aa  785    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2358  ATPase central domain-containing protein  68.75 
 
 
593 aa  714    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.164365 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16200  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit  54.72 
 
 
533 aa  524  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11860  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit  51.74 
 
 
584 aa  489  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0428496  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1971  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit  45.87 
 
 
521 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.1 
 
 
718 aa  203  6e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  41.2 
 
 
379 aa  197  4.0000000000000005e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.89 
 
 
808 aa  196  9e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.34 
 
 
759 aa  196  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.87 
 
 
721 aa  195  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.54 
 
 
760 aa  195  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.72 
 
 
735 aa  194  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.68 
 
 
743 aa  194  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.61 
 
 
731 aa  194  5e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  43.75 
 
 
412 aa  194  5e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  40.58 
 
 
393 aa  193  9e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.41 
 
 
740 aa  192  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.69 
 
 
731 aa  191  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.15 
 
 
731 aa  191  2e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.46 
 
 
739 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.9 
 
 
719 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.66 
 
 
740 aa  189  8e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.82 
 
 
731 aa  189  9e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.89 
 
 
806 aa  189  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40 
 
 
742 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.49 
 
 
757 aa  187  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  45.71 
 
 
732 aa  187  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  41.48 
 
 
810 aa  187  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.29 
 
 
736 aa  187  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  45.87 
 
 
754 aa  187  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.91 
 
 
763 aa  187  5e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.48 
 
 
742 aa  187  6e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.65 
 
 
781 aa  187  6e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.02 
 
 
754 aa  186  7e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.09 
 
 
754 aa  186  7e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.48 
 
 
781 aa  186  8e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.25 
 
 
784 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.87 
 
 
810 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.6 
 
 
768 aa  184  3e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.19 
 
 
701 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.69 
 
 
800 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.37 
 
 
754 aa  183  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.63 
 
 
723 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.18 
 
 
769 aa  183  7e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.4 
 
 
805 aa  183  7e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  38.18 
 
 
412 aa  183  7e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  44.91 
 
 
713 aa  183  8.000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  38.29 
 
 
691 aa  183  9.000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.02 
 
 
773 aa  182  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  41.91 
 
 
436 aa  181  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.18 
 
 
756 aa  181  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  43.4 
 
 
826 aa  182  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  36.9 
 
 
404 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.46 
 
 
732 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  43.28 
 
 
749 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.544283 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  37.54 
 
 
407 aa  181  4e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  42.13 
 
 
722 aa  181  4e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.89 
 
 
754 aa  180  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  38.1 
 
 
407 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  40.74 
 
 
407 aa  179  8e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  46.98 
 
 
739 aa  179  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.83 
 
 
852 aa  179  8e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  38.1 
 
 
407 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.02 
 
 
727 aa  179  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.63 
 
 
736 aa  179  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  36.65 
 
 
764 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  45.5 
 
 
746 aa  178  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.31 
 
 
753 aa  179  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>