More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2630 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_22080  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit  70.51 
 
 		 602 aa  855    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20900  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit  64.36 
 
 		 581 aa  717    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5891  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit- like protein  80 
 
 		 587 aa  921    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0900472 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1916  AAA ATPase central domain protein  61.95 
 
 		 583 aa  711    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000404322 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1866  AAA ATPase central domain protein  71.25 
 
 		 578 aa  783    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2241  ATPase central domain-containing protein  74.7 
 
 		 593 aa  881    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3069  vesicle-fusing ATPase  63.56 
 
 		 615 aa  783    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291044  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1838  AAA ATPase central domain-containing protein  78.61 
 
 		 587 aa  917    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1486  AAA ATPase central domain protein  75.6 
 
 		 586 aa  890    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178945  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1809  vesicle-fusing ATPase  75.56 
 
 		 584 aa  891    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0907  AAA ATPase central domain protein  61.38 
 
 		 579 aa  700    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.205473  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2004  AAA ATPase central domain protein  68.66 
 
 		 544 aa  729    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2153  AAA ATPase central domain protein  69.15 
 
 		 573 aa  771    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145525  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2975  AAA ATPase central domain protein  70.31 
 
 		 592 aa  823    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00499196  normal  0.0176892 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2458  AAA ATPase central domain protein  70.28 
 
 		 607 aa  779    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.839877  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2630  vesicle-fusing ATPase  100 
 
 		 602 aa  1212    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.609425  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4882  ATPase central domain-containing protein  90.58 
 
 		 601 aa  1053    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000159946  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4472  AAA ATPase central domain-containing protein  73.28 
 
 		 596 aa  861    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.163487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2678  AAA ATPase central domain protein  73.34 
 
 		 593 aa  870    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191022  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2358  ATPase central domain-containing protein  74.37 
 
 		 593 aa  873    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.164365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2307  AAA ATPase central domain protein  77.91 
 
 		 587 aa  925    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000305444  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1201  AAA ATPase central domain protein  64.35 
 
 		 550 aa  692    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.226586  normal  0.53529 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3132  vesicle-fusing ATPase  67.12 
 
 		 615 aa  790    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.594904  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2242  AAA ATPase central domain protein  65.77 
 
 		 560 aa  709    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2173  vesicle-fusing ATPase  61.5 
 
 		 594 aa  712    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0532603  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2231  AAA ATPase central domain protein  71.92 
 
 		 599 aa  848    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2423  AAA ATPase central domain protein  72.96 
 
 		 594 aa  852    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1184  vesicle-fusing ATPase  79.45 
 
 		 583 aa  917    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.89835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1485  AAA ATPase central domain protein  66.42 
 
 		 543 aa  712    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3144  vesicle-fusing ATPase  67.12 
 
 		 615 aa  790    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.844624 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12147  ATPase  66.72 
 
 		 609 aa  782    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2639  vesicle-fusing ATPase  75.09 
 
 		 584 aa  852    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.774976  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3194  vesicle-fusing ATPase  67.12 
 
 		 615 aa  790    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176841  normal  0.0401396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3458  vesicle-fusing ATPase  66.38 
 
 		 615 aa  781    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16200  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit  51.08 
 
 		 533 aa  500  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11860  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit  46.74 
 
 		 584 aa  464  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0428496  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1971  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit  45.32 
 
 		 521 aa  400  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.89 
 
 		 763 aa  201  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  48.58 
 
 		 810 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.69 
 
 		 754 aa  197  5.000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.93 
 
 		 718 aa  196  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.52 
 
 		 757 aa  195  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.32 
 
 		 701 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.03 
 
 		 808 aa  194  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.2 
 
 		 721 aa  194  3e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  43.25 
 
 		 754 aa  193  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.56 
 
 		 754 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.33 
 
 		 760 aa  191  2.9999999999999997e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.81 
 
 		 806 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.08 
 
 		 754 aa  189  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.83 
 
 		 719 aa  189  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.41 
 
 		 727 aa  188  3e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  41.57 
 
 		 746 aa  186  9e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.38 
 
 		 740 aa  186  9e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  46.34 
 
 		 713 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.89 
 
 		 852 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.76 
 
 		 759 aa  184  3e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.63 
 
 		 754 aa  184  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.23 
 
 		 742 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.59 
 
 		 731 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.67 
 
 		 723 aa  183  6e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.55 
 
 		 740 aa  183  7e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.59 
 
 		 731 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  41.33 
 
 		 732 aa  183  8.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.57 
 
 		 805 aa  183  9.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  41.18 
 
 		 739 aa  183  9.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.93 
 
 		 743 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.28 
 
 		 736 aa  182  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.14 
 
 		 732 aa  182  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  38.34 
 
 		 826 aa  182  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.98 
 
 		 781 aa  182  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0293  microtubule-severing ATPase  42.04 
 
 		 748 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.48554 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.64 
 
 		 735 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.45 
 
 		 769 aa  181  4e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.23 
 
 		 800 aa  181  4e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.23 
 
 		 784 aa  181  4e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  41.78 
 
 		 749 aa  181  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.544283 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.75 
 
 		 781 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  44.44 
 
 		 722 aa  179  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.15 
 
 		 736 aa  179  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.15 
 
 		 737 aa  178  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.67 
 
 		 737 aa  179  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.73 
 
 		 742 aa  178  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.73 
 
 		 768 aa  177  4e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.75 
 
 		 810 aa  177  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.64 
 
 		 739 aa  177  4e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.34 
 
 		 805 aa  177  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.67 
 
 		 801 aa  177  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.61 
 
 		 731 aa  177  5e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.52 
 
 		 709 aa  177  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0254  microtubule-severing ATPase  40.71 
 
 		 750 aa  176  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.19 
 
 		 738 aa  176  9e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  34.27 
 
 		 379 aa  176  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  43.89 
 
 		 764 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  39.69 
 
 		 832 aa  176  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.88 
 
 		 738 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.63 
 
 		 731 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  36.88 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  39.3 
 
 		 829 aa  174  2.9999999999999996e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0876334 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  39.13 
 
 		 393 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>