More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1201 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3069  vesicle-fusing ATPase  61.18 
 
 		 615 aa  687    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291044  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5891  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit- like protein  64.27 
 
 		 587 aa  688    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0900472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4882  ATPase central domain-containing protein  64.87 
 
 		 601 aa  681    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000159946  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1916  AAA ATPase central domain protein  62.5 
 
 		 583 aa  688    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000404322 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2153  AAA ATPase central domain protein  62.21 
 
 		 573 aa  693    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145525  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1866  AAA ATPase central domain protein  66.29 
 
 		 578 aa  694    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2975  AAA ATPase central domain protein  65.01 
 
 		 592 aa  702    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00499196  normal  0.0176892 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2307  AAA ATPase central domain protein  64.5 
 
 		 587 aa  682    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000305444  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20900  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit  68.16 
 
 		 581 aa  751    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1809  vesicle-fusing ATPase  65.35 
 
 		 584 aa  684    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2242  AAA ATPase central domain protein  66.07 
 
 		 560 aa  731    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1838  AAA ATPase central domain-containing protein  66.05 
 
 		 587 aa  694    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2241  ATPase central domain-containing protein  63.94 
 
 		 593 aa  659    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2458  AAA ATPase central domain protein  62.98 
 
 		 607 aa  696    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.839877  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2630  vesicle-fusing ATPase  64.6 
 
 		 602 aa  691    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.609425  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1201  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 550 aa  1125    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.226586  normal  0.53529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4472  AAA ATPase central domain-containing protein  63.67 
 
 		 596 aa  665    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.163487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22080  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit  64.72 
 
 		 602 aa  701    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1485  AAA ATPase central domain protein  69.65 
 
 		 543 aa  720    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3132  vesicle-fusing ATPase  62.03 
 
 		 615 aa  696    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.594904  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2173  vesicle-fusing ATPase  61.78 
 
 		 594 aa  681    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0532603  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3144  vesicle-fusing ATPase  62.03 
 
 		 615 aa  696    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.844624 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1184  vesicle-fusing ATPase  65.36 
 
 		 583 aa  691    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.89835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2639  vesicle-fusing ATPase  63.82 
 
 		 584 aa  667    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.774976  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1486  AAA ATPase central domain protein  62.76 
 
 		 586 aa  655    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178945  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3194  vesicle-fusing ATPase  62.03 
 
 		 615 aa  696    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176841  normal  0.0401396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2231  AAA ATPase central domain protein  62.77 
 
 		 599 aa  685    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377087  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3458  vesicle-fusing ATPase  61.57 
 
 		 615 aa  689    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2678  AAA ATPase central domain protein  64.1 
 
 		 593 aa  666    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191022  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2358  ATPase central domain-containing protein  64.13 
 
 		 593 aa  659    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.164365 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2004  AAA ATPase central domain protein  67.45 
 
 		 544 aa  727    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12147  ATPase  61.7 
 
 		 609 aa  698    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2423  AAA ATPase central domain protein  63.84 
 
 		 594 aa  696    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0907  AAA ATPase central domain protein  58.38 
 
 		 579 aa  617  1e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.205473  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16200  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit  51.38 
 
 		 533 aa  502  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11860  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit  48.47 
 
 		 584 aa  468  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0428496  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1971  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit  44.85 
 
 		 521 aa  400  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.12 
 
 		 718 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.51 
 
 		 731 aa  193  7e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.06 
 
 		 731 aa  193  7e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.55 
 
 		 740 aa  191  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.61 
 
 		 731 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.61 
 
 		 731 aa  191  4e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.44 
 
 		 721 aa  189  8e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.87 
 
 		 759 aa  188  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.49 
 
 		 701 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.15 
 
 		 739 aa  187  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.67 
 
 		 719 aa  187  5e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.45 
 
 		 760 aa  186  9e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.72 
 
 		 735 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  45.25 
 
 		 754 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  44.59 
 
 		 764 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.6 
 
 		 808 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  42.48 
 
 		 732 aa  184  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.93 
 
 		 806 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  43.36 
 
 		 810 aa  182  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.03 
 
 		 754 aa  181  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.31 
 
 		 805 aa  182  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.47 
 
 		 763 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.06 
 
 		 743 aa  182  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  44.14 
 
 		 763 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  41.74 
 
 		 749 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.544283 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.88 
 
 		 742 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.89 
 
 		 768 aa  181  4e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  37.37 
 
 		 722 aa  181  4e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.19 
 
 		 736 aa  181  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.63 
 
 		 740 aa  181  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  44.21 
 
 		 829 aa  180  4.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  46.08 
 
 		 832 aa  180  7e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  36.58 
 
 		 407 aa  179  8e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.6 
 
 		 723 aa  179  8e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  35.71 
 
 		 713 aa  179  9e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.38 
 
 		 784 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.5 
 
 		 736 aa  179  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.48 
 
 		 742 aa  179  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.6 
 
 		 781 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.36 
 
 		 738 aa  178  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.33 
 
 		 757 aa  179  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.83 
 
 		 738 aa  178  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.83 
 
 		 732 aa  179  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.24 
 
 		 781 aa  177  3e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.69 
 
 		 754 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  43.26 
 
 		 756 aa  177  4e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.13 
 
 		 800 aa  177  4e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  38.21 
 
 		 407 aa  177  4e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.44 
 
 		 754 aa  177  5e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  43.72 
 
 		 691 aa  177  6e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.1 
 
 		 754 aa  176  7e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.8 
 
 		 769 aa  176  7e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  37.86 
 
 		 407 aa  176  8e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36 
 
 		 737 aa  176  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.89 
 
 		 852 aa  176  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  37.5 
 
 		 407 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  35.17 
 
 		 379 aa  175  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  42.49 
 
 		 775 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.74 
 
 		 810 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  39.51 
 
 		 389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  37.98 
 
 		 402 aa  174  3.9999999999999995e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.45 
 
 		 727 aa  174  5e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.96 
 
 		 773 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>