More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05159 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05159  histidine kinase sensor protein  100 
 
 		 464 aa  947    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3602  histidine kinase  35.24 
 
 		 464 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0740  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.6 
 
 		 470 aa  259  7e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.350353 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 585 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 585 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 585 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1043  histidine kinase  34.01 
 
 		 585 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0039  histidine kinase  32.89 
 
 		 655 aa  117  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3444  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 511 aa  114  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0299421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  33.47 
 
 		 656 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0078  histidine kinase  36.61 
 
 		 475 aa  111  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3371  histidine kinase  36.44 
 
 		 887 aa  111  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.564838 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2807  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 505 aa  111  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 		 801 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36 
 
 		 1255 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 656 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  34.65 
 
 		 588 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4846  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.23 
 
 		 701 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.110474 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  33.61 
 
 		 585 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 586 aa  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  31.47 
 
 		 584 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  31.88 
 
 		 560 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  34.21 
 
 		 586 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 586 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 591 aa  107  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0671  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 987 aa  107  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.239322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0675  two-component sensor kinase CbrA  30.77 
 
 		 975 aa  106  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2812  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 495 aa  106  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 1092 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5501  two component sensor kinase  32.83 
 
 		 356 aa  106  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 511 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00545163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141182 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 		 585 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572324  normal  0.76853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.42 
 
 		 652 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3727  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.71 
 
 		 445 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.124248  normal  0.045206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4291  sensor histidine kinase  34.02 
 
 		 585 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 571 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 557 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 630 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3374  two-component sensor kinase CbrA  28.19 
 
 		 1000 aa  104  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.694338  normal  0.111505 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 623 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0073  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 505 aa  104  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1644  histidine kinase  33.19 
 
 		 779 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000228151 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4097  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 766 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 498 aa  103  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 577 aa  103  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2841  ATPase domain-containing protein  31.51 
 
 		 577 aa  103  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.274853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  29.96 
 
 		 673 aa  103  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 510 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13453  sensor histidine kinase/response regulator  29.17 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.264615  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 963 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4807  two-component sensor kinase CbrA  28.57 
 
 		 982 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111257 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18010  C4-dicarboylate transport sensory histidine protein kinase, two-component; DctB  33.77 
 
 		 592 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892386  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 970 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0172  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 565 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0914  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 343 aa  102  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3588  two-component sensor kinase CbrA  28.17 
 
 		 984 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.883039 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2844  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 550 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 711 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.598881  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 548 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3472  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 520 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 		 804 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4833  sensory box histidine kinase  25.93 
 
 		 899 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  30.26 
 
 		 548 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2188  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 572 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.363862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 588 aa  101  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206032  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5814  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 		 583 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552615  normal  0.0161436 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  33.78 
 
 		 1258 aa  101  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2227  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 665 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.670404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 		 812 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  33.05 
 
 		 1062 aa  100  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2216  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 475 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 523 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 654 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  28.03 
 
 		 627 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3556  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 523 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  32.89 
 
 		 581 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 588 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 492 aa  100  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 		 720 aa  99.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4196  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 680 aa  99.8  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0175164 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.32 
 
 		 793 aa  100  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 514 aa  100  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4925  sensory box sensor histidine kinase  33.48 
 
 		 614 aa  99.8  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 576 aa  99.8  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.45 
 
 		 966 aa  99.8  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  29.52 
 
 		 643 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  34.02 
 
 		 1061 aa  99.4  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  31.25 
 
 		 945 aa  99  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  29.52 
 
 		 643 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4373  PAS  25.07 
 
 		 907 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323082  normal  0.21328 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 448 aa  99.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  29.52 
 
 		 643 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  32.33 
 
 		 615 aa  99.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 584 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2304  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 460 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.757006  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1338 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216357  normal  0.0407933 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3689  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 655 aa  99.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 635 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.119976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>