More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3727 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3727  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 445 aa  909    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.124248  normal  0.045206 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2736  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  52.18 
 
 		 442 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.4 
 
 		 442 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2565  histidine kinase  51.86 
 
 		 442 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.19 
 
 		 445 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238926  normal  0.0632416 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2692  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.77 
 
 		 445 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.07 
 
 		 462 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.894513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2814  sensor histidine kinase  50.69 
 
 		 443 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3061  ATP-binding region ATPase domain protein  37.07 
 
 		 863 aa  171  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141845  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  35.86 
 
 		 524 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 919 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 1021 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1428  histidine kinase  33.1 
 
 		 457 aa  141  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  32.87 
 
 		 305 aa  139  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 683 aa  138  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3803  histone-like DNA-binding protein  35.97 
 
 		 308 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2403  sensor histidine kinase  32.41 
 
 		 601 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1123  sensor histidine kinase  32.81 
 
 		 471 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1200  sensor histidine kinase  32.81 
 
 		 471 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0788  sensor histidine kinase  32.81 
 
 		 465 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105833  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0677  sensor histidine kinase  32.81 
 
 		 538 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.755053  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 553 aa  137  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5807  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 		 990 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  32.46 
 
 		 505 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 467 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3516  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 		 614 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.166046 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0765  histidine kinase  28.67 
 
 		 601 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1953  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 458 aa  133  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1145  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 457 aa  132  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  33.9 
 
 		 1062 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 557 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1533  histidine kinase  32.87 
 
 		 497 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2797  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 480 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 589 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  34.64 
 
 		 439 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  30.94 
 
 		 730 aa  130  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1676  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 		 850 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109527  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0658  sensor histide kinase  32.16 
 
 		 315 aa  130  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 611 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 611 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  33.58 
 
 		 611 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5143  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  34.47 
 
 		 1061 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1854  histidine kinase  31.94 
 
 		 578 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1588  sensor histidine kinase  31.91 
 
 		 502 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153224  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 662 aa  128  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1855  histidine kinase  35.25 
 
 		 600 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.355606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1911  histidine kinase  32.53 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267492 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3526  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 584 aa  127  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 		 844 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 		 1465 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4122  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 449 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 594 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  34.41 
 
 		 445 aa  126  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 707 aa  126  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000535893  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0344  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 459 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337335  normal  0.899671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 		 842 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1774  histidine kinase  31.64 
 
 		 578 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  35.06 
 
 		 659 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  33.12 
 
 		 1850 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 602 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  33.95 
 
 		 917 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2102  histidine kinase  30.65 
 
 		 575 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1728  histidine kinase  32.29 
 
 		 560 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2545  sensor histidine kinase  30.7 
 
 		 429 aa  124  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1802  histidine kinase  32.29 
 
 		 540 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.963501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3096  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 659 aa  124  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  33.33 
 
 		 1187 aa  124  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 850 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346291  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4367  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 800 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.522603  normal  0.113968 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  31.06 
 
 		 408 aa  124  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0126  sensor histidine kinase  34.94 
 
 		 708 aa  123  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000118135  normal  0.929624 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  31.06 
 
 		 408 aa  124  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0675  two-component sensor kinase CbrA  31.34 
 
 		 975 aa  123  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18010  C4-dicarboylate transport sensory histidine protein kinase, two-component; DctB  37.75 
 
 		 592 aa  123  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892386  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3777  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 701 aa  123  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215477  hitchhiker  0.0067097 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2200  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 848 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00863508  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  35.98 
 
 		 681 aa  123  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 592 aa  122  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 486 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  36.89 
 
 		 592 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4457  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 661 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  33.33 
 
 		 588 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 713 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0360535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  32.88 
 
 		 586 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  29.96 
 
 		 310 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  30.61 
 
 		 358 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 630 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4130  histidine kinase  29.39 
 
 		 572 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.964997 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0975  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 683 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4039  histidine kinase  31.14 
 
 		 572 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26810  putative two-component sensor  32.78 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  34.43 
 
 		 548 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  30.47 
 
 		 1710 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 548 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 717 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>