More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1139 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0063  ferredoxin-dependent glutamate synthase  85.5 
 
 
463 aa  825    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0906024  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1139  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 
463 aa  930    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16282  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0458  ferredoxin-dependent glutamate synthase  62.36 
 
 
461 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000334759 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0142  ferredoxin-dependent glutamate synthase  63.09 
 
 
461 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.191381  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0505  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.71 
 
 
546 aa  108  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000290949  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1218  hypothetical protein  28.64 
 
 
547 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201873  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0045  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.37 
 
 
529 aa  104  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.46 
 
 
545 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000061126  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0402  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.12 
 
 
546 aa  100  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.441751 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2028  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32 
 
 
529 aa  100  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2289  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.88 
 
 
545 aa  99  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1424  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.71 
 
 
547 aa  97.1  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1750  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.06 
 
 
532 aa  95.9  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.134301  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1508  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.57 
 
 
532 aa  95.5  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  27.71 
 
 
500 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1693  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.68 
 
 
532 aa  94.4  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117443  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1179  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.67 
 
 
546 aa  94  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368179  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  27.35 
 
 
501 aa  94  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2628  glutamate synthase-related protein  26.05 
 
 
530 aa  93.6  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  24.79 
 
 
503 aa  92.8  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2665  hypothetical protein  28.99 
 
 
544 aa  91.3  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2034  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.75 
 
 
529 aa  90.5  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0305  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.14 
 
 
522 aa  89.7  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000055557  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  26.37 
 
 
502 aa  89.7  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  28.95 
 
 
507 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.18 
 
 
503 aa  87.8  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  27.64 
 
 
507 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2266  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.41 
 
 
551 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  27.03 
 
 
510 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  25.48 
 
 
503 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3762  glutamate synthase-related protein  28.12 
 
 
525 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000234985  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2809  glutamate synthase-like protein  28.61 
 
 
525 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223153  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  26.76 
 
 
502 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.16 
 
 
510 aa  83.2  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4067  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.05 
 
 
530 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  32.62 
 
 
510 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  33.16 
 
 
502 aa  82.4  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2029  glutamate synthase-like protein  28.64 
 
 
525 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000270819  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  32.28 
 
 
510 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  29.37 
 
 
507 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  27.09 
 
 
500 aa  81.3  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16450  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  27.58 
 
 
545 aa  81.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000101373  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.85 
 
 
502 aa  81.3  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  26.82 
 
 
500 aa  80.1  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  33.16 
 
 
507 aa  80.1  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  33.16 
 
 
507 aa  80.1  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  31.38 
 
 
497 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  26.58 
 
 
505 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  31.72 
 
 
500 aa  79  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1114  glutamate synthase (ferredoxin)  30.26 
 
 
1533 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82784  normal  0.930552 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  25.18 
 
 
529 aa  74.3  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  25.38 
 
 
437 aa  73.6  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1458  glutamate synthase  32.12 
 
 
1508 aa  73.6  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0475565  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5445  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.74 
 
 
1536 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5066  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.74 
 
 
1527 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5154  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.74 
 
 
1527 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.631687 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13895  ferredoxin-dependent glutamate synthase [NADPH] large subunit gltB  29.74 
 
 
1527 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1344  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.62 
 
 
441 aa  73.2  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  25.66 
 
 
466 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5698  glutamate synthase (ferredoxin)  29.23 
 
 
1514 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.471666 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.08 
 
 
509 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  33.16 
 
 
509 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  24.45 
 
 
529 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1136  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.44 
 
 
441 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.14 
 
 
516 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3022  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.23 
 
 
1519 aa  70.5  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  31.69 
 
 
530 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.21 
 
 
1525 aa  70.5  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2949  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.74 
 
 
1501 aa  70.5  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341665  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  30.96 
 
 
1524 aa  70.1  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3013  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.72 
 
 
1518 aa  70.1  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0945186 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  26.41 
 
 
518 aa  70.1  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0566  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.11 
 
 
543 aa  70.1  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212198  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3166  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.23 
 
 
1516 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.563815  normal  0.707717 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0101  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.89 
 
 
551 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2961  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.05 
 
 
1536 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.495295  normal  0.583434 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  30.22 
 
 
529 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4202  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.7 
 
 
529 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359651  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1935  glutamate synthase (ferredoxin)  28.72 
 
 
1548 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891386  normal  0.412086 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  34.69 
 
 
509 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2913  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.83 
 
 
529 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.57199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0118  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.38 
 
 
1537 aa  68.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.750611  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1078  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.21 
 
 
1513 aa  68.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.706498  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0474  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.05 
 
 
543 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185705  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  31.46 
 
 
1513 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0459  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  27.18 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.982817  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1322  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.65 
 
 
453 aa  68.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11000  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.05 
 
 
1550 aa  67.8  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.542266  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6006  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.75 
 
 
442 aa  67.8  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.762875  hitchhiker  0.00902062 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1173  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.21 
 
 
1520 aa  67.4  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.72 
 
 
1530 aa  67  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.53 
 
 
545 aa  67.4  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5693  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.57 
 
 
1512 aa  67  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.21 
 
 
1527 aa  67.4  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.75 
 
 
442 aa  67  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6577  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.27 
 
 
442 aa  67  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0337606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5512  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.63 
 
 
447 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6830  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.69 
 
 
526 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0827  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33 
 
 
541 aa  66.6  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0473902 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2807  glutamate synthase (ferredoxin)  31.22 
 
 
1512 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>