93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2028 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1693  ferredoxin-dependent glutamate synthase  74.48 
 
 		 532 aa  835    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117443  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1750  ferredoxin-dependent glutamate synthase  74.29 
 
 		 532 aa  840    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.134301  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2028  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 529 aa  1087    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4067  ferredoxin-dependent glutamate synthase  65.97 
 
 		 530 aa  762    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1508  ferredoxin-dependent glutamate synthase  78.6 
 
 		 532 aa  872    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2034  ferredoxin-dependent glutamate synthase  76.52 
 
 		 529 aa  867    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0045  ferredoxin-dependent glutamate synthase  79.13 
 
 		 529 aa  888    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2628  glutamate synthase-related protein  64.72 
 
 		 530 aa  731    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0305  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.14 
 
 		 522 aa  542  1e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000055557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2809  glutamate synthase-like protein  49.81 
 
 		 525 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3762  glutamate synthase-related protein  49.43 
 
 		 525 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000234985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16450  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  49.91 
 
 		 545 aa  522  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000101373  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1424  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.98 
 
 		 547 aa  510  1e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1179  ferredoxin-dependent glutamate synthase  47.08 
 
 		 546 aa  508  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0505  ferredoxin-dependent glutamate synthase  47.88 
 
 		 546 aa  503  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000290949  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2266  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.1 
 
 		 551 aa  500  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1218  hypothetical protein  46.22 
 
 		 547 aa  483  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201873  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2289  ferredoxin-dependent glutamate synthase  46.86 
 
 		 545 aa  481  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0402  ferredoxin-dependent glutamate synthase  45.14 
 
 		 546 aa  481  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.441751 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  45.42 
 
 		 545 aa  474  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000061126  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2029  glutamate synthase-like protein  48.12 
 
 		 525 aa  473  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000270819  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2665  hypothetical protein  46.06 
 
 		 544 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1139  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32 
 
 		 463 aa  100  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16282  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0063  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.98 
 
 		 463 aa  100  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0906024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0142  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.29 
 
 		 461 aa  92.4  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.191381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0458  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.68 
 
 		 461 aa  88.6  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000334759 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.04 
 
 		 502 aa  59.7  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  23.76 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  31.82 
 
 		 507 aa  57  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  31.82 
 
 		 507 aa  57  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  31.48 
 
 		 502 aa  56.6  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  29.52 
 
 		 507 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  29.72 
 
 		 500 aa  54.7  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  24.84 
 
 		 529 aa  54.7  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  30.4 
 
 		 507 aa  53.9  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  29.72 
 
 		 500 aa  53.5  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  31 
 
 		 530 aa  53.5  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.72 
 
 		 500 aa  53.5  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.68 
 
 		 507 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  31.39 
 
 		 510 aa  52.8  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  31.66 
 
 		 510 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.44 
 
 		 501 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  27.19 
 
 		 693 aa  52  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.65 
 
 		 455 aa  51.6  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0131  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.35 
 
 		 497 aa  51.2  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0899191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  31.66 
 
 		 510 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  32.06 
 
 		 529 aa  51.2  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.66 
 
 		 510 aa  50.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.41 
 
 		 492 aa  50.1  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  25.88 
 
 		 460 aa  50.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.53 
 
 		 529 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  31.66 
 
 		 500 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  26.13 
 
 		 497 aa  48.9  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  23.86 
 
 		 681 aa  48.5  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2018  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.21 
 
 		 472 aa  48.5  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  31.86 
 
 		 509 aa  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.74 
 
 		 509 aa  48.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4363  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.11 
 
 		 466 aa  47.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5751  glutamate synthase large subunit  26.55 
 
 		 442 aa  47.4  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  26.72 
 
 		 496 aa  47  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2312  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24 
 
 		 527 aa  46.6  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  25.89 
 
 		 503 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2536  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.39 
 
 		 525 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0256797  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  37.5 
 
 		 510 aa  46.6  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2487  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.39 
 
 		 525 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  30.97 
 
 		 509 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.17 
 
 		 547 aa  45.8  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6006  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.55 
 
 		 442 aa  45.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.762875  hitchhiker  0.00902062 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  27.31 
 
 		 685 aa  45.4  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3641  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.36 
 
 		 496 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.906462  normal  0.15864 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0867  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.32 
 
 		 507 aa  45.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1701  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.67 
 
 		 448 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3699  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.36 
 
 		 496 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0656612  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2409  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.87 
 
 		 504 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.550103  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3823  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.36 
 
 		 496 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  33.06 
 
 		 502 aa  45.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  22.54 
 
 		 515 aa  44.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  32.17 
 
 		 684 aa  44.7  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.55 
 
 		 442 aa  44.3  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6577  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.99 
 
 		 442 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0337606 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0806  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.57 
 
 		 496 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.235708  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4808  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.58 
 
 		 442 aa  44.3  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0816928  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1136  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.49 
 
 		 441 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.6 
 
 		 545 aa  43.9  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  26.54 
 
 		 503 aa  43.9  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  29.08 
 
 		 501 aa  43.9  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1944  putative large subunit of glutamate synthase  25.5 
 
 		 441 aa  43.9  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.438663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1573  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.58 
 
 		 448 aa  43.9  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1658  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.58 
 
 		 447 aa  43.5  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3522  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.69 
 
 		 458 aa  43.5  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0650047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1940  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.58 
 
 		 447 aa  43.5  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  37.5 
 
 		 502 aa  43.5  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.62 
 
 		 546 aa  43.5  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>