51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2809 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0305  ferredoxin-dependent glutamate synthase  62.48 
 
 		 522 aa  688    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000055557  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2029  glutamate synthase-like protein  74.62 
 
 		 525 aa  798    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000270819  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2809  glutamate synthase-like protein  100 
 
 		 525 aa  1082    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3762  glutamate synthase-related protein  79.69 
 
 		 525 aa  868    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000234985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2034  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.45 
 
 		 529 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1693  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.63 
 
 		 532 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117443  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1750  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.67 
 
 		 532 aa  559  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.134301  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1508  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.38 
 
 		 532 aa  550  1e-155  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4067  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.72 
 
 		 530 aa  548  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0045  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.81 
 
 		 529 aa  535  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2628  glutamate synthase-related protein  49.9 
 
 		 530 aa  532  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2028  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.81 
 
 		 529 aa  529  1e-149  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16450  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  44.17 
 
 		 545 aa  420  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000101373  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.94 
 
 		 545 aa  419  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000061126  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1179  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.4 
 
 		 546 aa  419  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0402  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.26 
 
 		 546 aa  409  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.441751 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0505  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.89 
 
 		 546 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000290949  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1424  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.9 
 
 		 547 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2289  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.95 
 
 		 545 aa  399  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1218  hypothetical protein  40.27 
 
 		 547 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201873  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2266  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.57 
 
 		 551 aa  376  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2665  hypothetical protein  40.12 
 
 		 544 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0063  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.95 
 
 		 463 aa  97.1  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0906024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1139  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.61 
 
 		 463 aa  84.3  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16282  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0142  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.89 
 
 		 461 aa  83.2  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.191381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0458  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.14 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000334759 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.06 
 
 		 516 aa  72  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.16 
 
 		 516 aa  66.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  24.58 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  25.38 
 
 		 529 aa  63.5  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  22.4 
 
 		 516 aa  62  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.17 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  25.68 
 
 		 529 aa  58.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  26.62 
 
 		 529 aa  57  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  23.58 
 
 		 515 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  23.53 
 
 		 437 aa  55.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.47 
 
 		 502 aa  53.9  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  23.77 
 
 		 510 aa  53.5  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.55 
 
 		 547 aa  52.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.9 
 
 		 546 aa  52  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.98 
 
 		 545 aa  50.8  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4363  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.51 
 
 		 466 aa  50.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.67 
 
 		 455 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  22.67 
 
 		 492 aa  48.9  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  27.67 
 
 		 518 aa  47.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  26.39 
 
 		 496 aa  45.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2536  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.53 
 
 		 525 aa  44.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0256797  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2487  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.53 
 
 		 525 aa  44.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  26.81 
 
 		 460 aa  44.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3121  ferredoxin-dependent glutamate synthase  23.6 
 
 		 535 aa  44.3  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0236823  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1944  putative large subunit of glutamate synthase  27.07 
 
 		 441 aa  43.5  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.438663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>