48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1218 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0402  ferredoxin-dependent glutamate synthase  69.47 
 
 		 546 aa  816    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.441751 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0505  ferredoxin-dependent glutamate synthase  70.66 
 
 		 546 aa  833    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000290949  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2266  ferredoxin-dependent glutamate synthase  68.61 
 
 		 551 aa  786    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2665  hypothetical protein  78.24 
 
 		 544 aa  894    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16450  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  66.91 
 
 		 545 aa  777    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000101373  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2289  ferredoxin-dependent glutamate synthase  80.77 
 
 		 545 aa  947    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1424  ferredoxin-dependent glutamate synthase  61.04 
 
 		 547 aa  706    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  72.78 
 
 		 545 aa  832    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000061126  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1218  hypothetical protein  100 
 
 		 547 aa  1131    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201873  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1179  ferredoxin-dependent glutamate synthase  73.62 
 
 		 546 aa  859    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4067  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.83 
 
 		 530 aa  544  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2034  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.09 
 
 		 529 aa  528  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1508  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.54 
 
 		 532 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1750  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.44 
 
 		 532 aa  510  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.134301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1693  ferredoxin-dependent glutamate synthase  47.89 
 
 		 532 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117443  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0045  ferredoxin-dependent glutamate synthase  46.68 
 
 		 529 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2628  glutamate synthase-related protein  48.09 
 
 		 530 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2028  ferredoxin-dependent glutamate synthase  46.22 
 
 		 529 aa  483  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0305  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.23 
 
 		 522 aa  404  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000055557  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3762  glutamate synthase-related protein  41.03 
 
 		 525 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000234985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2809  glutamate synthase-like protein  40.27 
 
 		 525 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223153  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2029  glutamate synthase-like protein  40.77 
 
 		 525 aa  362  1e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000270819  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1139  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.64 
 
 		 463 aa  107  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16282  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0063  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.74 
 
 		 463 aa  104  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0906024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0458  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.27 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000334759 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0142  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.27 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.191381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  32.24 
 
 		 529 aa  59.7  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  34.35 
 
 		 529 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.88 
 
 		 529 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.15 
 
 		 492 aa  53.5  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  26.01 
 
 		 496 aa  53.5  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.46 
 
 		 510 aa  50.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.47 
 
 		 546 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.86 
 
 		 547 aa  50.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  31.67 
 
 		 518 aa  47.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  37.5 
 
 		 515 aa  47.8  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.25 
 
 		 516 aa  47.4  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.05 
 
 		 545 aa  46.6  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  22.9 
 
 		 455 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.76 
 
 		 514 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.25 
 
 		 516 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  29.79 
 
 		 502 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.46 
 
 		 460 aa  46.2  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.25 
 
 		 516 aa  45.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3121  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.56 
 
 		 535 aa  44.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0236823  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  27.32 
 
 		 502 aa  44.7  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5512  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.68 
 
 		 447 aa  43.9  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  34.52 
 
 		 466 aa  43.9  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>