45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_16450 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1424  ferredoxin-dependent glutamate synthase  65.14 
 
 		 547 aa  752    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2266  ferredoxin-dependent glutamate synthase  67.58 
 
 		 551 aa  783    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2665  hypothetical protein  64.04 
 
 		 544 aa  739    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16450  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  100 
 
 		 545 aa  1121    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000101373  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2289  ferredoxin-dependent glutamate synthase  64.77 
 
 		 545 aa  754    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0505  ferredoxin-dependent glutamate synthase  69.12 
 
 		 546 aa  816    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000290949  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  64.71 
 
 		 545 aa  770    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000061126  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1179  ferredoxin-dependent glutamate synthase  72.98 
 
 		 546 aa  862    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0402  ferredoxin-dependent glutamate synthase  64.63 
 
 		 546 aa  766    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.441751 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1218  hypothetical protein  66.91 
 
 		 547 aa  777    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2034  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.1 
 
 		 529 aa  559  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1508  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.08 
 
 		 532 aa  555  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4067  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.3 
 
 		 530 aa  551  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2628  glutamate synthase-related protein  53.79 
 
 		 530 aa  553  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1693  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.29 
 
 		 532 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117443  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1750  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.48 
 
 		 532 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.134301  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0045  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.37 
 
 		 529 aa  522  1e-147  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2028  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.91 
 
 		 529 aa  522  1e-147  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3762  glutamate synthase-related protein  44.34 
 
 		 525 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000234985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0305  ferredoxin-dependent glutamate synthase  44.59 
 
 		 522 aa  426  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000055557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2809  glutamate synthase-like protein  44.17 
 
 		 525 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223153  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2029  glutamate synthase-like protein  43.32 
 
 		 525 aa  390  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000270819  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0063  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.48 
 
 		 463 aa  87.4  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0906024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1139  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.58 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16282  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0142  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.68 
 
 		 461 aa  80.1  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.191381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0458  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.95 
 
 		 461 aa  76.6  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000334759 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.71 
 
 		 547 aa  50.4  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  35 
 
 		 515 aa  48.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  33.72 
 
 		 518 aa  47.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.44 
 
 		 546 aa  47.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.94 
 
 		 545 aa  47.8  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.72 
 
 		 516 aa  47.4  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  31.3 
 
 		 529 aa  47  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.75 
 
 		 514 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  26.04 
 
 		 502 aa  45.8  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.94 
 
 		 516 aa  45.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  28.35 
 
 		 437 aa  45.4  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.01 
 
 		 529 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.94 
 
 		 516 aa  44.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.69 
 
 		 492 aa  44.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  23.83 
 
 		 460 aa  45.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.75 
 
 		 510 aa  44.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  31.4 
 
 		 466 aa  44.3  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  25.39 
 
 		 530 aa  43.5  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.03 
 
 		 440 aa  43.5  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.922442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>