99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1693 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2028  ferredoxin-dependent glutamate synthase  74.48 
 
 		 529 aa  835    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1693  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 532 aa  1086    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117443  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4067  ferredoxin-dependent glutamate synthase  69.13 
 
 		 530 aa  792    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2628  glutamate synthase-related protein  67.3 
 
 		 530 aa  754    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1508  ferredoxin-dependent glutamate synthase  78.83 
 
 		 532 aa  876    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2034  ferredoxin-dependent glutamate synthase  83.02 
 
 		 529 aa  921    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1750  ferredoxin-dependent glutamate synthase  96.43 
 
 		 532 aa  1054    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.134301  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0045  ferredoxin-dependent glutamate synthase  71.89 
 
 		 529 aa  816    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0305  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.79 
 
 		 522 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000055557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2809  glutamate synthase-like protein  53.63 
 
 		 525 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3762  glutamate synthase-related protein  52.67 
 
 		 525 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000234985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16450  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  52.29 
 
 		 545 aa  539  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000101373  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0505  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.55 
 
 		 546 aa  538  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000290949  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1424  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.37 
 
 		 547 aa  537  1e-151  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1179  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.64 
 
 		 546 aa  536  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2029  glutamate synthase-like protein  51.18 
 
 		 525 aa  518  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000270819  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2266  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49 
 
 		 551 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0402  ferredoxin-dependent glutamate synthase  47.26 
 
 		 546 aa  510  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.441751 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  47.09 
 
 		 545 aa  511  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000061126  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2289  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.52 
 
 		 545 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1218  hypothetical protein  47.89 
 
 		 547 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201873  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2665  hypothetical protein  47.15 
 
 		 544 aa  478  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0063  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.17 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0906024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1139  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.68 
 
 		 463 aa  94.4  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16282  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0142  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.16 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.191381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0458  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.16 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000334759 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  27.48 
 
 		 437 aa  69.7  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.9 
 
 		 529 aa  63.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  29.55 
 
 		 529 aa  62.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  29.63 
 
 		 529 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.85 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.08 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.82 
 
 		 496 aa  58.9  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4363  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.88 
 
 		 466 aa  57  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  30.63 
 
 		 500 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  27.37 
 
 		 530 aa  55.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.32 
 
 		 455 aa  55.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  29.73 
 
 		 500 aa  55.1  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.63 
 
 		 500 aa  53.9  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.95 
 
 		 460 aa  53.9  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  29.49 
 
 		 510 aa  53.5  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  24.05 
 
 		 693 aa  53.5  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.77 
 
 		 545 aa  53.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  30.59 
 
 		 507 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  28.64 
 
 		 510 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  30.59 
 
 		 507 aa  52.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  28.64 
 
 		 510 aa  52.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.64 
 
 		 510 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3522  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.43 
 
 		 458 aa  50.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0650047 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  27.87 
 
 		 507 aa  50.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2312  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.42 
 
 		 527 aa  50.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  25.23 
 
 		 509 aa  50.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1944  putative large subunit of glutamate synthase  27.47 
 
 		 441 aa  50.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.438663 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  23.04 
 
 		 510 aa  50.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.82 
 
 		 442 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6577  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.57 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0337606 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2536  ferredoxin-dependent glutamate synthase  22.98 
 
 		 525 aa  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0256797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  26.15 
 
 		 509 aa  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  30.96 
 
 		 502 aa  48.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1136  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.29 
 
 		 441 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5751  glutamate synthase large subunit  27.48 
 
 		 442 aa  48.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  27.98 
 
 		 507 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2487  ferredoxin-dependent glutamate synthase  22.98 
 
 		 525 aa  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  25 
 
 		 509 aa  48.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  22.98 
 
 		 516 aa  47.8  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  23.81 
 
 		 681 aa  47.4  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1344  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.36 
 
 		 441 aa  47.4  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6006  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.36 
 
 		 442 aa  47.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.762875  hitchhiker  0.00902062 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  26.34 
 
 		 507 aa  47  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  29.95 
 
 		 503 aa  47  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0169  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.44 
 
 		 456 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4808  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.47 
 
 		 442 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0816928  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3706  hypothetical protein  25.21 
 
 		 522 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.553853  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5512  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.91 
 
 		 447 aa  47  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  22.79 
 
 		 516 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5640  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.64 
 
 		 442 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0331257  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3397  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.21 
 
 		 522 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  25.46 
 
 		 502 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3436  hypothetical protein  25.21 
 
 		 522 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247668  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4697  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.36 
 
 		 445 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3656  hypothetical protein  25.21 
 
 		 522 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  29.73 
 
 		 503 aa  46.2  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1940  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.04 
 
 		 447 aa  45.8  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.78 
 
 		 547 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1573  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.04 
 
 		 448 aa  46.2  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1658  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.04 
 
 		 447 aa  46.2  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  32.54 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0131  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.18 
 
 		 497 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0899191  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3348  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.21 
 
 		 522 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.62 
 
 		 546 aa  45.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  24.35 
 
 		 503 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3332  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.71 
 
 		 522 aa  44.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150799  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25 
 
 		 516 aa  44.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1485  Glutamate synthase (NADPH)  29.06 
 
 		 519 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  27.85 
 
 		 497 aa  44.3  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  25.21 
 
 		 518 aa  44.3  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2634  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.52 
 
 		 444 aa  43.9  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.89 
 
 		 447 aa  43.9  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.375524  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1297  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.22 
 
 		 454 aa  43.5  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.361733  normal  0.326718 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>