46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0402 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0402  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 546 aa  1123    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.441751 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16450  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  64.63 
 
 		 545 aa  766    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000101373  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1218  hypothetical protein  69.47 
 
 		 547 aa  816    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201873  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1424  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.78 
 
 		 547 aa  700    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1179  ferredoxin-dependent glutamate synthase  72.41 
 
 		 546 aa  859    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2289  ferredoxin-dependent glutamate synthase  70.74 
 
 		 545 aa  818    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2665  hypothetical protein  69.87 
 
 		 544 aa  788    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  72.04 
 
 		 545 aa  841    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000061126  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2266  ferredoxin-dependent glutamate synthase  68.19 
 
 		 551 aa  791    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0505  ferredoxin-dependent glutamate synthase  67.4 
 
 		 546 aa  811    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000290949  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2034  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.1 
 
 		 529 aa  549  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1508  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.91 
 
 		 532 aa  532  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4067  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.8 
 
 		 530 aa  519  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1750  ferredoxin-dependent glutamate synthase  47.99 
 
 		 532 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.134301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1693  ferredoxin-dependent glutamate synthase  47.26 
 
 		 532 aa  510  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2628  glutamate synthase-related protein  47.52 
 
 		 530 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0045  ferredoxin-dependent glutamate synthase  46.34 
 
 		 529 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2028  ferredoxin-dependent glutamate synthase  45.14 
 
 		 529 aa  481  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0305  ferredoxin-dependent glutamate synthase  44.4 
 
 		 522 aa  438  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000055557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2809  glutamate synthase-like protein  42.26 
 
 		 525 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3762  glutamate synthase-related protein  41.68 
 
 		 525 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000234985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2029  glutamate synthase-like protein  40.84 
 
 		 525 aa  375  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000270819  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1139  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.12 
 
 		 463 aa  100  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16282  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0063  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.27 
 
 		 463 aa  99.4  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0906024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0142  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.98 
 
 		 461 aa  72  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.191381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0458  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.96 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000334759 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  29.11 
 
 		 529 aa  55.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.91 
 
 		 516 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  29.29 
 
 		 529 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.19 
 
 		 514 aa  49.3  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.17 
 
 		 529 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36 
 
 		 545 aa  49.3  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.41 
 
 		 440 aa  49.3  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.922442  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.06 
 
 		 510 aa  48.9  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  23.9 
 
 		 515 aa  48.5  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30 
 
 		 547 aa  48.1  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  27.6 
 
 		 496 aa  48.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.17 
 
 		 516 aa  47.8  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.46 
 
 		 492 aa  47.8  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.23 
 
 		 516 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.75 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  36.61 
 
 		 518 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.5 
 
 		 502 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.66 
 
 		 546 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2536  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.45 
 
 		 525 aa  43.9  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0256797  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2487  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.45 
 
 		 525 aa  43.9  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>