44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2289 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0402  ferredoxin-dependent glutamate synthase  70.74 
 
 		 546 aa  818    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.441751 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16450  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  64.77 
 
 		 545 aa  754    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000101373  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1218  hypothetical protein  80.77 
 
 		 547 aa  947    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201873  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2665  hypothetical protein  86.76 
 
 		 544 aa  972    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1179  ferredoxin-dependent glutamate synthase  73.9 
 
 		 546 aa  860    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1424  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.18 
 
 		 547 aa  689    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  73.53 
 
 		 545 aa  846    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000061126  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2289  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 545 aa  1124    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2266  ferredoxin-dependent glutamate synthase  70.07 
 
 		 551 aa  791    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0505  ferredoxin-dependent glutamate synthase  71.51 
 
 		 546 aa  827    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000290949  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4067  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.57 
 
 		 530 aa  522  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2034  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.72 
 
 		 529 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1750  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.71 
 
 		 532 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.134301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1693  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.52 
 
 		 532 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117443  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1508  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.71 
 
 		 532 aa  503  1e-141  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2628  glutamate synthase-related protein  49.17 
 
 		 530 aa  499  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0045  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.06 
 
 		 529 aa  489  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2028  ferredoxin-dependent glutamate synthase  46.86 
 
 		 529 aa  481  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0305  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.21 
 
 		 522 aa  404  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000055557  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3762  glutamate synthase-related protein  42.67 
 
 		 525 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000234985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2809  glutamate synthase-like protein  41.95 
 
 		 525 aa  399  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223153  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2029  glutamate synthase-like protein  41.51 
 
 		 525 aa  362  7.0000000000000005e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000270819  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1139  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.88 
 
 		 463 aa  99  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16282  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0063  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.52 
 
 		 463 aa  95.1  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0906024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0458  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.18 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000334759 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0142  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.79 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.191381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  28.19 
 
 		 529 aa  57  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.69 
 
 		 492 aa  55.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  27.46 
 
 		 529 aa  54.7  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  27.5 
 
 		 529 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.51 
 
 		 546 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.54 
 
 		 547 aa  51.6  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.75 
 
 		 510 aa  51.2  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.24 
 
 		 516 aa  51.2  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  38.75 
 
 		 515 aa  50.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  38.75 
 
 		 518 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.87 
 
 		 502 aa  48.5  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.5 
 
 		 516 aa  48.5  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  25.56 
 
 		 496 aa  48.5  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.5 
 
 		 516 aa  48.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.27 
 
 		 514 aa  47.8  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.15 
 
 		 440 aa  47.8  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.922442  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  37.5 
 
 		 466 aa  47  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.02 
 
 		 545 aa  45.8  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>