More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0142 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0458  ferredoxin-dependent glutamate synthase  95.01 
 
 
461 aa  858    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000334759 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0142  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 
461 aa  917    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.191381  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1139  ferredoxin-dependent glutamate synthase  62.58 
 
 
463 aa  599  1e-170  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16282  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0063  ferredoxin-dependent glutamate synthase  63.08 
 
 
463 aa  597  1e-169  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0906024  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2028  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.29 
 
 
529 aa  97.4  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1508  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.29 
 
 
532 aa  95.5  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2628  glutamate synthase-related protein  25 
 
 
530 aa  92.8  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0505  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.6 
 
 
546 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000290949  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.06 
 
 
503 aa  92.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  28.87 
 
 
502 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1693  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.16 
 
 
532 aa  90.9  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117443  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0305  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.66 
 
 
522 aa  90.5  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000055557  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0045  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.93 
 
 
529 aa  89.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1750  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.73 
 
 
532 aa  89  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.134301  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  35.48 
 
 
500 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  27.57 
 
 
502 aa  87.4  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  36.02 
 
 
500 aa  87.4  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16450  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  27.5 
 
 
545 aa  87  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000101373  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2809  glutamate synthase-like protein  28.89 
 
 
525 aa  87  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223153  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  35.48 
 
 
500 aa  86.7  8e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3762  glutamate synthase-related protein  25.34 
 
 
525 aa  86.7  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000234985  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  28.7 
 
 
505 aa  86.7  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  27.51 
 
 
503 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4067  ferredoxin-dependent glutamate synthase  23.81 
 
 
530 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1424  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.4 
 
 
547 aa  84  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  34.57 
 
 
500 aa  84  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  35.39 
 
 
502 aa  84  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2289  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.79 
 
 
545 aa  84  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1218  hypothetical protein  27.27 
 
 
547 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201873  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  34.48 
 
 
510 aa  83.2  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1179  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.94 
 
 
546 aa  82.8  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368179  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.53 
 
 
502 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.24 
 
 
501 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  34.48 
 
 
510 aa  83.2  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  34.41 
 
 
510 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.99 
 
 
510 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.32 
 
 
545 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000061126  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  34.93 
 
 
507 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.43 
 
 
507 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2266  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.87 
 
 
551 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  36.16 
 
 
507 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  35.03 
 
 
507 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1322  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.91 
 
 
453 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  35.03 
 
 
507 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  27.46 
 
 
503 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  33.51 
 
 
509 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2665  hypothetical protein  27.79 
 
 
544 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0402  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.98 
 
 
546 aa  75.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.441751 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2029  glutamate synthase-like protein  28.57 
 
 
525 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000270819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2034  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.02 
 
 
529 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  33.33 
 
 
530 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  32.8 
 
 
497 aa  75.5  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  32.45 
 
 
509 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.43 
 
 
509 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  34.41 
 
 
501 aa  72  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1136  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.85 
 
 
441 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.44 
 
 
1510 aa  71.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6577  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.13 
 
 
442 aa  70.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0337606 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  25.87 
 
 
437 aa  70.9  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.64 
 
 
442 aa  70.1  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3522  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.02 
 
 
458 aa  70.5  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0650047 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6006  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.64 
 
 
442 aa  70.1  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.762875  hitchhiker  0.00902062 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1944  putative large subunit of glutamate synthase  28.64 
 
 
441 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.438663 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  23.8 
 
 
741 aa  68.9  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5751  glutamate synthase large subunit  28.64 
 
 
442 aa  68.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5512  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.06 
 
 
447 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1344  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.57 
 
 
441 aa  67.8  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2585  glutamate synthase family protein  29.06 
 
 
446 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00726879  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2250  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.06 
 
 
441 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5640  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.67 
 
 
442 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0331257  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2276  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.06 
 
 
446 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574266  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1940  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.16 
 
 
447 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1573  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.16 
 
 
448 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1658  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.16 
 
 
447 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  24.33 
 
 
684 aa  66.6  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  26.89 
 
 
712 aa  66.2  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3465  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.08 
 
 
440 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57505  normal  0.540858 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  30.73 
 
 
1513 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  22.62 
 
 
440 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.922442  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2634  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.11 
 
 
444 aa  66.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  26.69 
 
 
518 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4697  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.16 
 
 
445 aa  65.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0459  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  27.67 
 
 
444 aa  65.9  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.982817  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4808  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.67 
 
 
442 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0816928  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  22.39 
 
 
529 aa  64.3  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17041  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.71 
 
 
1523 aa  63.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17161  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.71 
 
 
1524 aa  63.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  26.6 
 
 
747 aa  63.5  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  24.23 
 
 
529 aa  63.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.71 
 
 
1524 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.64 
 
 
1525 aa  63.2  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1868  putative glutamate synthase large subunit-like protein  27.75 
 
 
444 aa  62.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.553438  normal  0.798632 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.43 
 
 
1519 aa  62.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  31.71 
 
 
1487 aa  62.4  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.88 
 
 
545 aa  62  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1482  glutamate synthase, large subunit  28.89 
 
 
1473 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1604  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.14 
 
 
1468 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3022  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.21 
 
 
1519 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0474  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.4 
 
 
543 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185705  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1297  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.76 
 
 
454 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.361733  normal  0.326718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>