104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1750 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2628  glutamate synthase-related protein  67.11 
 
 		 530 aa  754    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0045  ferredoxin-dependent glutamate synthase  71.7 
 
 		 529 aa  822    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1508  ferredoxin-dependent glutamate synthase  79.4 
 
 		 532 aa  885    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4067  ferredoxin-dependent glutamate synthase  69.38 
 
 		 530 aa  795    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2028  ferredoxin-dependent glutamate synthase  74.29 
 
 		 529 aa  840    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1693  ferredoxin-dependent glutamate synthase  96.43 
 
 		 532 aa  1054    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117443  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1750  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 532 aa  1082    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.134301  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2034  ferredoxin-dependent glutamate synthase  83.21 
 
 		 529 aa  926    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0305  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.98 
 
 		 522 aa  578  1e-164  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000055557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2809  glutamate synthase-like protein  52.67 
 
 		 525 aa  559  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3762  glutamate synthase-related protein  51.91 
 
 		 525 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000234985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0505  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.1 
 
 		 546 aa  541  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000290949  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1179  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50 
 
 		 546 aa  540  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16450  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  52.48 
 
 		 545 aa  541  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000101373  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1424  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.37 
 
 		 547 aa  535  1e-151  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2266  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.54 
 
 		 551 aa  520  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2029  glutamate synthase-like protein  50.2 
 
 		 525 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000270819  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  47.27 
 
 		 545 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000061126  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0402  ferredoxin-dependent glutamate synthase  47.99 
 
 		 546 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.441751 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1218  hypothetical protein  48.44 
 
 		 547 aa  510  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201873  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2289  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.71 
 
 		 545 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2665  hypothetical protein  47.51 
 
 		 544 aa  480  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0063  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.63 
 
 		 463 aa  100  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0906024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1139  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.06 
 
 		 463 aa  95.9  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16282  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0458  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.96 
 
 		 461 aa  82.8  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000334759 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0142  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.73 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.191381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  28.24 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  27.08 
 
 		 529 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.85 
 
 		 502 aa  62  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.45 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.64 
 
 		 529 aa  60.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  29.28 
 
 		 529 aa  60.5  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  26.89 
 
 		 496 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.5 
 
 		 545 aa  57  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  27.18 
 
 		 530 aa  57  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4363  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.05 
 
 		 466 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  23.28 
 
 		 510 aa  54.7  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  25 
 
 		 509 aa  53.5  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  24.31 
 
 		 693 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  27.16 
 
 		 510 aa  53.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.68 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  30.88 
 
 		 507 aa  52.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  30.88 
 
 		 507 aa  52.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  25.94 
 
 		 460 aa  51.6  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2312  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.09 
 
 		 527 aa  52  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  21.36 
 
 		 516 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  30.32 
 
 		 500 aa  52  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  27.87 
 
 		 507 aa  51.6  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  29.41 
 
 		 500 aa  51.2  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  26.25 
 
 		 509 aa  51.2  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  21.43 
 
 		 516 aa  50.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  28.18 
 
 		 510 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.32 
 
 		 500 aa  50.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  28.18 
 
 		 510 aa  50.8  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.18 
 
 		 510 aa  50.4  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  24.76 
 
 		 509 aa  49.7  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  27.98 
 
 		 507 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  31.12 
 
 		 502 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1944  putative large subunit of glutamate synthase  26.18 
 
 		 441 aa  48.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.438663 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2487  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.17 
 
 		 525 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2536  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.17 
 
 		 525 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0256797  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.77 
 
 		 546 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  25.83 
 
 		 502 aa  48.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  26.34 
 
 		 507 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  30.61 
 
 		 503 aa  47.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0131  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.73 
 
 		 497 aa  47.8  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0899191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.23 
 
 		 516 aa  47.8  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  24.81 
 
 		 503 aa  47  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.91 
 
 		 442 aa  47  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  29.73 
 
 		 503 aa  47  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1136  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.87 
 
 		 441 aa  47  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3436  hypothetical protein  24.79 
 
 		 522 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3397  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.79 
 
 		 522 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3706  hypothetical protein  24.79 
 
 		 522 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.553853  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.78 
 
 		 547 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3656  hypothetical protein  24.79 
 
 		 522 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3522  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.7 
 
 		 458 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0650047 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5751  glutamate synthase large subunit  25.7 
 
 		 442 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6577  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.64 
 
 		 442 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0337606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1485  Glutamate synthase (NADPH)  29.56 
 
 		 519 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3348  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.79 
 
 		 522 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1344  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.03 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6006  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.45 
 
 		 442 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.762875  hitchhiker  0.00902062 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  21.79 
 
 		 514 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0169  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.41 
 
 		 456 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  23.92 
 
 		 681 aa  46.2  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  27.98 
 
 		 497 aa  45.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5512  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.11 
 
 		 447 aa  45.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5640  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.23 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0331257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  23.23 
 
 		 466 aa  44.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  22.25 
 
 		 502 aa  44.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4697  ferredoxin-dependent glutamate synthase  23.85 
 
 		 445 aa  44.3  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3332  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.31 
 
 		 522 aa  44.3  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150799  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2018  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.85 
 
 		 472 aa  44.3  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4808  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.61 
 
 		 442 aa  44.3  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0816928  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  24.05 
 
 		 518 aa  44.3  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  27.96 
 
 		 501 aa  43.9  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1658  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.61 
 
 		 447 aa  43.9  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0867  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.32 
 
 		 507 aa  43.9  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3020  Glutamate synthase (NADPH)  28.95 
 
 		 564 aa  43.9  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0605315 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>