93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1508 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0045  ferredoxin-dependent glutamate synthase  76.66 
 
 		 529 aa  870    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2028  ferredoxin-dependent glutamate synthase  78.6 
 
 		 529 aa  872    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1750  ferredoxin-dependent glutamate synthase  79.4 
 
 		 532 aa  885    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.134301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4067  ferredoxin-dependent glutamate synthase  70.13 
 
 		 530 aa  812    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1508  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 532 aa  1098    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2034  ferredoxin-dependent glutamate synthase  84.28 
 
 		 529 aa  940    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1693  ferredoxin-dependent glutamate synthase  78.83 
 
 		 532 aa  876    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2628  glutamate synthase-related protein  68.43 
 
 		 530 aa  777    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0305  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.95 
 
 		 522 aa  556  1e-157  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000055557  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16450  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  54.08 
 
 		 545 aa  555  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000101373  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0505  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.48 
 
 		 546 aa  551  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000290949  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2809  glutamate synthase-like protein  50.38 
 
 		 525 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223153  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1179  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.1 
 
 		 546 aa  550  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1424  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.1 
 
 		 547 aa  547  1e-154  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3762  glutamate synthase-related protein  49.04 
 
 		 525 aa  535  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000234985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0402  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.91 
 
 		 546 aa  532  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.441751 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2266  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.27 
 
 		 551 aa  530  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.35 
 
 		 545 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000061126  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1218  hypothetical protein  49.54 
 
 		 547 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201873  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2289  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.71 
 
 		 545 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2029  glutamate synthase-like protein  48.99 
 
 		 525 aa  499  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000270819  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2665  hypothetical protein  48.61 
 
 		 544 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0063  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.39 
 
 		 463 aa  95.5  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0906024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1139  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.57 
 
 		 463 aa  95.5  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16282  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0142  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.29 
 
 		 461 aa  90.9  5e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.191381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0458  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.59 
 
 		 461 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000334759 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  27.54 
 
 		 437 aa  66.6  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  27.35 
 
 		 529 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  25.56 
 
 		 502 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  23.3 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  26.39 
 
 		 500 aa  55.8  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  25.31 
 
 		 529 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4363  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.32 
 
 		 466 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2536  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.7 
 
 		 525 aa  55.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0256797  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2487  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.7 
 
 		 525 aa  55.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  31.98 
 
 		 530 aa  54.3  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  25.12 
 
 		 460 aa  54.3  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  35.38 
 
 		 529 aa  54.3  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.67 
 
 		 455 aa  53.5  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  26.12 
 
 		 500 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  23.92 
 
 		 515 aa  52.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  27.76 
 
 		 496 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  30.9 
 
 		 507 aa  52  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  26.13 
 
 		 693 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  30.9 
 
 		 507 aa  52  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  25.05 
 
 		 507 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6006  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.1 
 
 		 442 aa  50.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.762875  hitchhiker  0.00902062 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25 
 
 		 440 aa  50.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.922442  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  27.37 
 
 		 507 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  22.7 
 
 		 516 aa  50.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.21 
 
 		 500 aa  50.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  21.08 
 
 		 514 aa  49.7  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5751  glutamate synthase large subunit  26.29 
 
 		 442 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  23.75 
 
 		 510 aa  48.9  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.27 
 
 		 545 aa  49.3  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1701  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.56 
 
 		 448 aa  48.5  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  28.1 
 
 		 507 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1344  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.48 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.26 
 
 		 547 aa  48.5  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  29.68 
 
 		 510 aa  48.1  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.21 
 
 		 447 aa  48.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.375524  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1136  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.15 
 
 		 441 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  20.44 
 
 		 516 aa  47.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  30 
 
 		 502 aa  47.8  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  25.32 
 
 		 497 aa  47.4  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  23.98 
 
 		 546 aa  47  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  24.92 
 
 		 466 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2312  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.77 
 
 		 527 aa  47  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6577  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.64 
 
 		 442 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0337606 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.17 
 
 		 442 aa  47  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1940  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.36 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1944  putative large subunit of glutamate synthase  27.56 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.438663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1573  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.36 
 
 		 448 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  28.32 
 
 		 510 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  28.32 
 
 		 510 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0169  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.23 
 
 		 456 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.32 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4697  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.74 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1658  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.36 
 
 		 447 aa  46.2  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2409  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.54 
 
 		 504 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.550103  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  20.77 
 
 		 516 aa  45.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  36.54 
 
 		 510 aa  45.1  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0131  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.57 
 
 		 497 aa  45.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0899191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4808  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.91 
 
 		 442 aa  45.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0816928  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5640  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.7 
 
 		 442 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0331257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  22.78 
 
 		 501 aa  45.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2018  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.26 
 
 		 472 aa  44.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1995  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.49 
 
 		 530 aa  45.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000483561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5512  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.14 
 
 		 447 aa  45.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3522  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.12 
 
 		 458 aa  43.9  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0650047 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.15 
 
 		 509 aa  43.5  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0088  hypothetical protein  27.23 
 
 		 523 aa  43.5  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0076  hypothetical protein  27.23 
 
 		 523 aa  43.5  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>