49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2029 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2809  glutamate synthase-like protein  74.62 
 
 		 525 aa  830    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223153  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0305  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.31 
 
 		 522 aa  648    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000055557  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2029  glutamate synthase-like protein  100 
 
 		 525 aa  1076    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000270819  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3762  glutamate synthase-related protein  73.61 
 
 		 525 aa  820    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000234985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2034  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.96 
 
 		 529 aa  551  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1693  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.95 
 
 		 532 aa  536  1e-151  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117443  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1750  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50 
 
 		 532 aa  534  1e-150  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.134301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4067  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.29 
 
 		 530 aa  526  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2628  glutamate synthase-related protein  48.95 
 
 		 530 aa  518  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1508  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.73 
 
 		 532 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0045  ferredoxin-dependent glutamate synthase  47.86 
 
 		 529 aa  498  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2028  ferredoxin-dependent glutamate synthase  47.89 
 
 		 529 aa  489  1e-137  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16450  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  43.32 
 
 		 545 aa  403  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000101373  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1179  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.34 
 
 		 546 aa  403  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.18 
 
 		 545 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000061126  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0505  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.82 
 
 		 546 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000290949  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0402  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.07 
 
 		 546 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.441751 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1424  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.95 
 
 		 547 aa  388  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2289  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.78 
 
 		 545 aa  375  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1218  hypothetical protein  39.82 
 
 		 547 aa  375  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201873  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2266  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.68 
 
 		 551 aa  371  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2665  hypothetical protein  40.49 
 
 		 544 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0063  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.85 
 
 		 463 aa  94.4  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0906024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1139  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.64 
 
 		 463 aa  87.8  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16282  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.44 
 
 		 516 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0142  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.95 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.191381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0458  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.78 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000334759 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.39 
 
 		 516 aa  63.9  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.65 
 
 		 514 aa  61.6  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  22.77 
 
 		 516 aa  58.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.13 
 
 		 502 aa  58.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  24 
 
 		 466 aa  57  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  28.29 
 
 		 529 aa  55.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  23.97 
 
 		 515 aa  54.7  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  24.66 
 
 		 437 aa  54.3  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  25.25 
 
 		 518 aa  54.3  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  25.99 
 
 		 529 aa  53.5  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.15 
 
 		 545 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.48 
 
 		 546 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  23.56 
 
 		 510 aa  52  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.82 
 
 		 547 aa  48.5  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  25.9 
 
 		 529 aa  48.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  25.23 
 
 		 530 aa  47.8  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  24.58 
 
 		 747 aa  47  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4363  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25 
 
 		 466 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  26.34 
 
 		 684 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.45 
 
 		 440 aa  45.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.922442  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3020  Glutamate synthase (NADPH)  25.71 
 
 		 564 aa  43.9  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0605315 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1434  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.45 
 
 		 543 aa  43.9  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>