75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4067 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1750  ferredoxin-dependent glutamate synthase  69.38 
 
 		 532 aa  795    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.134301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2628  glutamate synthase-related protein  73.11 
 
 		 530 aa  834    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2034  ferredoxin-dependent glutamate synthase  71.78 
 
 		 529 aa  827    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1693  ferredoxin-dependent glutamate synthase  69.13 
 
 		 532 aa  792    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117443  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2028  ferredoxin-dependent glutamate synthase  65.97 
 
 		 529 aa  762    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0045  ferredoxin-dependent glutamate synthase  66.86 
 
 		 529 aa  773    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4067  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 530 aa  1095    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1508  ferredoxin-dependent glutamate synthase  70.13 
 
 		 532 aa  812    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0305  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.23 
 
 		 522 aa  558  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000055557  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1179  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.41 
 
 		 546 aa  561  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16450  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  52.3 
 
 		 545 aa  551  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000101373  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0505  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.77 
 
 		 546 aa  549  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000290949  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2809  glutamate synthase-like protein  49.72 
 
 		 525 aa  548  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223153  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1218  hypothetical protein  51.83 
 
 		 547 aa  544  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201873  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3762  glutamate synthase-related protein  49.43 
 
 		 525 aa  544  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000234985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1424  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.66 
 
 		 547 aa  537  1e-151  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2266  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.92 
 
 		 551 aa  530  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.91 
 
 		 545 aa  522  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000061126  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2289  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.57 
 
 		 545 aa  522  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0402  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.8 
 
 		 546 aa  519  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.441751 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2029  glutamate synthase-like protein  49.01 
 
 		 525 aa  511  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000270819  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2665  hypothetical protein  50.28 
 
 		 544 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1139  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.05 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16282  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0142  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.43 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.191381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0063  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.71 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0906024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0458  ferredoxin-dependent glutamate synthase  23.73 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000334759 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  27.04 
 
 		 437 aa  63.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.92 
 
 		 502 aa  59.7  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  27.76 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  31.31 
 
 		 530 aa  55.1  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  29.49 
 
 		 510 aa  55.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  29.49 
 
 		 510 aa  55.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.49 
 
 		 510 aa  54.7  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  29.68 
 
 		 500 aa  53.9  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.9 
 
 		 500 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  26.96 
 
 		 510 aa  53.5  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  27.62 
 
 		 507 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  29.22 
 
 		 500 aa  51.6  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  32.99 
 
 		 502 aa  51.6  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  28.09 
 
 		 529 aa  51.6  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  23.3 
 
 		 455 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  25.59 
 
 		 507 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0867  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.45 
 
 		 507 aa  49.7  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  27.23 
 
 		 496 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  26.2 
 
 		 497 aa  48.9  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1136  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.74 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.63 
 
 		 509 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  28.89 
 
 		 507 aa  48.5  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  28.89 
 
 		 507 aa  48.5  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  26.46 
 
 		 502 aa  48.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.03 
 
 		 501 aa  48.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.89 
 
 		 503 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.54 
 
 		 492 aa  48.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4697  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.32 
 
 		 445 aa  48.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  26.35 
 
 		 507 aa  47.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  27.72 
 
 		 693 aa  47.4  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  30 
 
 		 509 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5751  glutamate synthase large subunit  25.22 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  27.31 
 
 		 529 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  28.65 
 
 		 684 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6006  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.77 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.762875  hitchhiker  0.00902062 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  22.97 
 
 		 515 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2018  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.94 
 
 		 472 aa  45.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1944  putative large subunit of glutamate synthase  24.89 
 
 		 441 aa  45.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.438663 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  30.46 
 
 		 501 aa  45.4  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5640  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.12 
 
 		 442 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0331257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6577  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.77 
 
 		 442 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0337606 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  31.97 
 
 		 529 aa  45.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.3 
 
 		 442 aa  44.3  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  28.21 
 
 		 503 aa  44.3  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.27 
 
 		 545 aa  44.3  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2536  ferredoxin-dependent glutamate synthase  23.5 
 
 		 525 aa  44.3  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0256797  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2487  ferredoxin-dependent glutamate synthase  23.5 
 
 		 525 aa  44.3  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.34 
 
 		 514 aa  44.3  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  32.54 
 
 		 510 aa  43.5  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>