More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0837 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0837  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 
462 aa  908    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.439147  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1430  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  52.47 
 
 
446 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0746057  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24220  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  48.41 
 
 
448 aa  382  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0385  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.22 
 
 
452 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1418  putative transcriptional regulator  41.39 
 
 
532 aa  283  5.000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0044  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
445 aa  278  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5225  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.03 
 
 
441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.260155 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5410  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.67 
 
 
441 aa  262  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0940  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.08 
 
 
462 aa  229  5e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0465159  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1472  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
449 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2819  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
467 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4186  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  37.38 
 
 
436 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  0.0862967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2672  GntR-family transcriptional regulator  34.72 
 
 
430 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.562569  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2802  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
430 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2696  GntR family transcriptional regulator  34.49 
 
 
430 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2630  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
430 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520726  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4213  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 
432 aa  196  8.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0990086  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2581  GntR-family transcriptional regulator  34.2 
 
 
430 aa  196  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4117  transcriptional regulator with aminotransferase and DNA binding domains (possibly involved in vitB6 biosynthesis)  33.18 
 
 
431 aa  186  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00360  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  35.45 
 
 
455 aa  186  9e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1566  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.57 
 
 
444 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.58 
 
 
428 aa  170  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.268016  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2563  transcriptional regulator  33.56 
 
 
434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0018  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.48 
 
 
442 aa  159  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316764  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4162  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0017  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
442 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  24.05 
 
 
477 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1658  regulatory protein GntR HTH  31.53 
 
 
498 aa  126  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  29.83 
 
 
493 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2133  GntR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
476 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5181  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.22 
 
 
447 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2044  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  30 
 
 
468 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00402201  hitchhiker  0.0000000000000583102 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1618  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
468 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.64 
 
 
461 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24687  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1735  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
468 aa  120  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453488  hitchhiker  0.0000000000634797 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01396  fused predicted DNA-binding transcriptional regulator/predicted amino transferase  30.09 
 
 
468 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.09 
 
 
468 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2220  transcriptional regulator  30.09 
 
 
468 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01407  hypothetical protein  30.09 
 
 
468 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  29.49 
 
 
484 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1434  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
480 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.515471 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1523  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
468 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.03 
 
 
479 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.38477  normal  0.137274 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
444 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3968  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.59 
 
 
464 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  29.35 
 
 
474 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0766  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
473 aa  116  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.124102  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.22 
 
 
444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.22 
 
 
444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  27.02 
 
 
482 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0486  GntR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.39 
 
 
473 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  27.17 
 
 
500 aa  114  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  28.7 
 
 
474 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1713  aminotransferase, classes I and II superfamily  28.7 
 
 
474 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
473 aa  113  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1778  aminotransferase, classes I and II superfamily  28.7 
 
 
474 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1743  aminotransferase  28.7 
 
 
474 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3329  GntR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
515 aa  113  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.895754  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2931  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
500 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  28.41 
 
 
517 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3030  transcriptional regulator  28.17 
 
 
537 aa  113  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3396  GntR family transcriptional regulator  26.44 
 
 
473 aa  113  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  26.75 
 
 
498 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2175  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.31 
 
 
498 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.09 
 
 
468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  27.07 
 
 
470 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0539  transcriptional regulator  27.98 
 
 
462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0353345 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  28.45 
 
 
479 aa  111  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2147  putative transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 
453 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2793  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
444 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.102841 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  24.18 
 
 
477 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4267  putative transcriptional regulator, GntR family  29.4 
 
 
454 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0342  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.02 
 
 
482 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00152858  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
473 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 
444 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
473 aa  109  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 
496 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.18 
 
 
470 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
487 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1101  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
464 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0519  GntR family transcriptional regulator  26.46 
 
 
460 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  28.44 
 
 
474 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 
496 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  24.73 
 
 
482 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  24.73 
 
 
482 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 
491 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2317  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 
462 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2010  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.83 
 
 
483 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348528  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
469 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4193  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
466 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1922  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
470 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  24.19 
 
 
479 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0573  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
470 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  29.24 
 
 
500 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0157  GntR family transcriptional regulator  21.36 
 
 
454 aa  107  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.790011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>