More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4213 on replicon NC_009425
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009425  Ent638_4213  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
432 aa  882    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0990086  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4117  transcriptional regulator with aminotransferase and DNA binding domains (possibly involved in vitB6 biosynthesis)  47.42 
 
 
431 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2696  GntR family transcriptional regulator  45.35 
 
 
430 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2672  GntR-family transcriptional regulator  45.35 
 
 
430 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.562569  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2802  GntR family transcriptional regulator  45.35 
 
 
430 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2581  GntR-family transcriptional regulator  45.35 
 
 
430 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2630  GntR family transcriptional regulator  45.12 
 
 
430 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520726  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.39 
 
 
428 aa  386  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.268016  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00360  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  41.78 
 
 
455 aa  335  9e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4186  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  36.72 
 
 
436 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  0.0862967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1566  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.91 
 
 
444 aa  242  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2563  transcriptional regulator  36.62 
 
 
434 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0017  GntR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
442 aa  205  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0018  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.99 
 
 
442 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316764  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4162  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
442 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1430  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.72 
 
 
446 aa  187  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0746057  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0837  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.51 
 
 
462 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.439147  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24220  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  32.39 
 
 
448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0940  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.67 
 
 
462 aa  167  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0465159  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0385  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.75 
 
 
452 aa  158  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5225  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.03 
 
 
441 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.260155 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5410  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.4 
 
 
441 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0044  GntR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1418  putative transcriptional regulator  27.86 
 
 
532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1472  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
449 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1082  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  29.27 
 
 
457 aa  113  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.029023  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  27.21 
 
 
474 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1713  aminotransferase, classes I and II superfamily  27.21 
 
 
474 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  27.21 
 
 
474 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1743  aminotransferase  27.21 
 
 
474 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1778  aminotransferase, classes I and II superfamily  27.21 
 
 
474 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  27.94 
 
 
484 aa  107  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2022  transcriptional regulator  25.1 
 
 
509 aa  107  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190123  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2819  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
467 aa  106  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  24.32 
 
 
468 aa  103  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  24.39 
 
 
444 aa  102  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2793  GntR family transcriptional regulator  25.35 
 
 
444 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.102841 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  26.8 
 
 
498 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  24.76 
 
 
444 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2235  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.55 
 
 
473 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.71743 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  25.54 
 
 
496 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1062  MocR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
473 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  25.54 
 
 
496 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.76 
 
 
444 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.76 
 
 
444 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2212  GntR family transcriptional regulator  23.9 
 
 
468 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  24.76 
 
 
444 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  24.59 
 
 
444 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01396  fused predicted DNA-binding transcriptional regulator/predicted amino transferase  26.68 
 
 
468 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.68 
 
 
468 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2220  transcriptional regulator  26.68 
 
 
468 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2044  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  26.68 
 
 
468 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00402201  hitchhiker  0.0000000000000583102 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01407  hypothetical protein  26.68 
 
 
468 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.6 
 
 
471 aa  99.8  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1523  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
468 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1735  GntR family transcriptional regulator  26.68 
 
 
468 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453488  hitchhiker  0.0000000000634797 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.53 
 
 
468 aa  99.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1618  GntR family transcriptional regulator  26.68 
 
 
468 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4072  GntR family transcriptional regulator  24.71 
 
 
458 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  27.13 
 
 
472 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  26.27 
 
 
476 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  26.51 
 
 
496 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  26.23 
 
 
500 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  24.64 
 
 
473 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000386  transcriptional regulator GntR family  25.97 
 
 
471 aa  97.8  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.882947  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  25.87 
 
 
493 aa  97.1  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  24.56 
 
 
483 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
491 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1658  regulatory protein GntR HTH  26.86 
 
 
498 aa  96.3  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3599  putative transcriptional regulator, GntR family  24.68 
 
 
470 aa  96.3  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.34 
 
 
490 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  25.8 
 
 
470 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1890  transcriptional regulator  25.11 
 
 
488 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278936  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  25.24 
 
 
480 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  25.24 
 
 
480 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  25.24 
 
 
480 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  25.24 
 
 
480 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  25.38 
 
 
470 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  25.24 
 
 
480 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.24 
 
 
480 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  25.24 
 
 
480 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  24.45 
 
 
480 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.38 
 
 
488 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2133  GntR family transcriptional regulator  26.44 
 
 
476 aa  94.4  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2027  GntR family transcriptional regulator  25.38 
 
 
383 aa  94  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  26.72 
 
 
498 aa  94  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  23.08 
 
 
482 aa  94  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  23.88 
 
 
480 aa  93.6  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  24.4 
 
 
473 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  23.68 
 
 
482 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6386  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 
470 aa  93.6  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.157204 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
492 aa  93.6  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2129  GntR family transcriptional regulator  24.64 
 
 
469 aa  93.6  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.98832  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5788  GntR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
496 aa  93.2  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0096  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  23.61 
 
 
473 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  24.76 
 
 
480 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
397 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4138  GntR family transcriptional regulator  23.06 
 
 
470 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  25.95 
 
 
397 aa  92  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4436  transcriptional regulator  24.78 
 
 
514 aa  91.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313734  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>